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臺灣史 -- 鄭氏王朝
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滿人入關
生 活在長城以北，也就是俗稱關外的滿州人，在一五九九年（明神宗 萬曆二十七年），有感文字的重要，因而仿蒙古文而創作滿文。 從此滿人日益強大。有了文字僅僅四十五年即在一六四四年以不足三十萬的軍隊，入主中國。他們也根本也沒有想到，竟然如此輕易即可佔領、統治漢民族達二百六 十八年之久。
滿人在語言、文字、衣著、生活習慣上，與漢民族有絕對的不同。滿人男子之頭髮在前額部份將髮剃光，只剩下後腦蓄髮，長到六十公分左右，就把它結成辮。其他在服裝上、文化、生活水準也有極大的差距。
長城是中國與胡人千年來的國界。自秦始皇（二五九BC至二一○BC）時就動用極龐大的國家資源建立萬里長城，它是區別華夷、文明與野蠻的歷史產物。明末長城山海關守將吳三桂無敵我意識，在個人利益為優先的考量下，無視漢民族將受到的摧殘而邀請滿人入關。
滿 清之兵入關後，原本並無問鼎中原之野心，亦無足夠肆虐之武力，但能長驅直入，是採取以漢治漢 政策，每以封爵地盤，籠絡明朝降將，以此所向無敵。明末雖有忠義之士如史可法、黃道周等皆無法嚇阻清兵的攻勢，更談不上予以嚴重的打擊。其他的人不是望風 逃竄，就是靦腆投敵。若有心懷對抗異族之心的忠義之士，而沒有抗敵的武力，僅慷慨就義，多數是「平時拱手談心性，臨危一死報君恩」的儒生，與大局無補，中 原一片土崩瓦解，漢人無法對抗。如此漢民族再度遭受異族的統治，但就在閩粵之地，就讓滿人花了近四十年方征服最後一塊有漢民族意識的鄭氏王朝。
一 六四四年（明崇禎十七年、清順治元年）三月十九日崇禎皇帝自縊北京煤山 ，中國一片混亂。南方各地尋找有俱皇帝血統而成立的南明政權計有弘光（福王）、隆武（唐王）、魯王（監國）、永曆（桂王朱由榔）等，所稱的南明四王。 南明國家恢復的重任，前後寄望於流寇餘孽如高傑、李成棟、孫可望及海盜出身的鄭芝龍（又名鄭一官）等。
一六四四年五月福王由崧即位南京，明年改元弘光。次年四月揚州破史可法戰死，福王遇害。
一六四五年（弘光元年、隆武元年、順治二年）五月張國維等迎魯王於紹興，即監國位。
閏六月唐王聿鍵 由鄭芝龍、鄭鴻逵及鄭彩的閩南軍在福州（天興府）擁立唐王即位，是為隆武帝，改元隆武。芝龍封為「平國公」身兼戶、兵、工三部尚書。
魯 監國派遣都督陳謙為使來到福州會見唐王隆武帝。 陳謙與鄭芝龍是舊識，在弘光時（一六四四年），南京的福王弘光差陳謙為使，持印敕到閩府封芝龍為「南安 伯」，但是印章確誤刻為「安南伯」。南安是指小地名，而安南確是俱有大格局之意，所以陳謙教鄭芝龍，留下印章更換敕文，此事讓鄭芝龍十分感謝。 陳謙回到 浙江時，弘光帝業已蒙塵。陳謙雖沒有將安南伯的敕文更正，但是陳謙與鄭芝龍確建立起深厚的友誼。
這次陳謙奉魯王之命來到閩（福建）福 州，先與舊友兼唐王的支持者鄭芝龍招呼敘舊。 但是陳謙見到隆武帝時口稱為皇叔父，而沒有稱「陛下」，引起隆武帝大怒，並下獄。鄭芝龍得知後極力援救。隆武短視，瞞騙鄭芝龍，將陳謙在半夜移他所斬之。 鄭芝龍搶救不及，伏屍大哭。如此也造成鄭芝龍的離心。
這樣在福建的隆武與在浙江臺州的魯王（魯監國）不合，相互爭名。並互殺使者，標榜抗清的南明二王，在閩浙之間如同水火不容，忘卻了反清復明的大事。如此清軍輕易渡過錢塘江。
鄭成功
一六二四年（明 天啟四年）八月二十七日（陰曆七月十四日）生于日本九州平戶，是鄭芝龍之長子，福建省泉州安南縣四十三都 石井安平鎮 。母為日本田川氏 ，名福松，回國後名森，號大木。
鄭成功的父親鄭芝龍是縱橫東亞、南亞海上的霸主。漢民族千年來是以陸權立國，對海上不屑一顧。明末的海盜、倭寇為患，不思根本鏟除，而以「片板不得入海」這種消極的方法處理。鄭芝龍從海盜晉升為大明的官軍，再而擁立唐王聿鍵為隆武帝，如此業已掌控國家命脈。
鄭 成功在日本出生，七歲（一六三一年）時回到泉州，當時日本在幕府時代，女人是不准出境，所以只有鄭成功回來。十五歲入南安縣為「秀才」，再經考試，為南安 二十個「廩膳生」 之一，後拜浙江虞山大儒錢謙益 為師。所以鄭成功不但能詩、能文，也擅長書法。同時他又耳濡目染父親的各種軍事活動，周邊也圍繞著歷經海上風霜的鄭芝龍親信。十八歲時與董夫人結婚，而董 夫人係明禮部侍郎董颺光之胞侄女。次年生長子鄭經（乳名錦），及長到南京入太學，後由芝龍安排見隆武帝，芝龍原意是就近偵伺隆武帝，但隆武帝見成功貌偉， 撫其背曰：「惜無一女配卿，卿當盡忠吾家，無相忘也。」 一六四五年隆武帝詔賜鄭成功賜姓朱，名成功，封忠孝伯，賜尚方寶劍便宜行事，掛詔討大將軍印。從 此大家尊稱為「國姓爺」（Koxinga）。 隆武帝也賜姓給鄭鴻逵之子鄭肇基，人稱鄭肇基為小國姓。
鄭芝龍降清
鄭 芝龍本質上是國家民族觀念淡薄，是以追求自身的安全與財富為重，所以清軍南下時，意存觀望。一六四六年鄭芝龍借故海寇入犯，須往駐防，將仙霞關守將施天福 全數撤防，以利清兵之到來。清軍出韶州抵仙霞關，仙霞關二百里，無一守兵，於是清兵八月入福建，佔浦城、霞浦。福州陷入無險可守之境，隆武帝奔汀州，被清 兵所捉，絕食而亡。此時鄭芝龍兵屯家鄉安平 ，舟艦尚有五、六百艘。
清貝勒 博洛主持對閩浙戰役，因而求教於招撫江南經略洪承疇 ，他是降清明臣亦是鄭芝龍的小同鄉。 洪承疇認為明隆武帝之所有兵馬錢糧都由鄭芝龍所提供。所以鄭芝龍是關鍵人物，只要給予王爵之銜，他若靠來則福建可以不勞而獲，浙江也順勢可得。
於 是博洛派人到安平向鄭芝龍招降。芝龍接到洪承疇之書信，承諾給予三省王爵。 鄭芝龍就意向投清，但仍說「恐以立君為罪！」博洛立即退軍三十里再寫信說道： 「吾所以重將軍者，以將軍能立唐藩也；若將軍不輔立，兵未至而先附，何所取重哉！兩粵未平，將藉將軍聽威懾之，今鑄『閩粵總督印』以相待。欲將軍來見者， 商地方人才也。」 這是一項以虛有的閩粵總督之官爵來引誘的技倆，而鄭芝龍又對隆武帝的失望，鄭芝龍準備向清博洛貝勒投降，此時鄭鴻逵、鄭成功及其他將領 都加勸阻。部將周崔芝說很可惜，這樣芝龍二十年的威望，一下子就墮落下來。 鄭成功向父阻止說：「閩粵之地，非北方，得以任意馳驅。若憑高恃險，設伏以 禦，雖有百萬，恐一旦亦難飛過。然後收拾人心，以固其本。大開海道，興販各港，以足其餉；然後選將練兵，以實其力；號召天下，進取不難矣。」 鄭芝龍卻 說：「識時務為俊傑，今招我重我，就之必禮我，苟與爭鋒，一旦失利，搖尾乞憐，那時追悔莫及。豎子渺視，慎勿多談。」 成功見父不從，牽其衣，跪哭曰： 「夫虎不可離山，離山不武；魚不可離淵，離淵則困。吾父當三思而行。」芝龍反而向鄭成功說：「稚子妄談，不知天時地勢。」
成功出見到芝 龍之弟鄭鴻逵，將投清之事告向叔父。於是鄭鴻逵向鄭芝龍說：「夫人生天地間如朝露耳，能建功立業，垂名異世，則亦時不可失也。吾兄當國難之際，位極人臣， 苟時事不可為，則弟亦不敢虛鼓唇舌。況且尚帶甲數十萬，舳艫塞海，糧餉充足，輔其君以號召天下，豪傑自當響應，何委身於人？此弟所不取也！」 芝龍曰： 「吾弟所言，眼前之事，非長遠計耳。甲申 之變天下鼎沸，亦失其鹿，故清朝得而逐之，業已三皆有二。若以小丈夫之氣，振一旅而敵天下兵，恐亦不量力也。不如乘其招我，全軍歸誠，擇主而事。」 鄭芝 龍並沒有接受弟、子、部屬這些有理的勸阻。 鄭成功見父無可理喻，帶了一批人遁往金門。
鄭芝龍挑選五百名壯卒，盔甲鮮明，往福州面博洛， 同時又差人到金門，尋成功同行。成功不從回信道：「從來父教子以忠，未聞教子以貳，今父不聽兒言，倘有不測，兒只有縞素而已。」 鄭芝龍率五百人及五子鄭 世渡，自安平住所到福州天興府，向清貝勒博洛投降，路過泉州時取出博洛之信誇示眩耀，並向有興趣求官的人談價錢。 博洛得知鄭芝龍啟程來降，即令沿途各府 縣接應，凡所過驛站，供奉威儀甚嫄，又令文武官員郊外相迎。
到了福州與博洛折箭為誓，並薙髮。貝勒命酒痛飲三日，分散其五百兵，半夜忽拔營，挾持芝龍，送到北京。 鄭芝龍就這樣不明不白陷入絕境。
德國Albrecht Wirth稱鄭芝龍的降清是「滿人為捉麻雀而配的圈套竟也能適用於老鷹。」也符合西方人的一句諺語「短視到看不到自已的鼻子。」
如 果從鄭芝龍的立場來看投清之事，他原本是海盜在一六二八年應明朝之招撫，成為明朝之海將，以掃蕩海上「私通販夷」為名，將海盜同業一一制服，建立海上霸 業。進一步掌控南明國家命脈。 如今滿清南下，不久將一統中國，所以他回想以海盜成為海將的經驗，若早日投入滿清旗下，未來將有可能從海而陸，一步登天。可惜人算不若天算，豈能盡如芝龍 之意。
鄭芝龍降清之後，其原有的部隊軍事力量，也隨之分化瓦解，各自為謀，部份將領降清事敵，並沒有留什麼給鄭成功。為數眾多的鄭芝龍部屬，大都徘徊於順逆之間不知所從。
成功起兵抗清
鄭 芝龍一投降，福建沿海、廣東大部份則跟著陷入清軍掌握，清軍博洛令韓代將所部的滿漢騎步兵馬竄入鄭芝龍的家鄉安平。本以為鄭芝龍降清之後，其家鄉可視為滿 清的一部份，所以也沒防備，但是清軍開入安平，有如進入敵境，大肆掠奪並強姦鄭成功之母翁氏 ，隨後其母自縊身亡（一六四六年十一月三十日）。 成功得知消息痛不欲生，詣孔廟，焚儒服，拜而誓曰：「昔為孺子，今為孤臣，向背去留各有所用，謹謝儒服，祈先師昭鑒」遂折師海上，謀匡復大明江山，時年二 十三歲。
鄭成功之前未曾一日有兵權，意氣容貌，是儒生，在這種環境下，鄭成功不懼，一六四六年（明隆武二年、清順治三年）鄭成功決意起兵 與其弟鄭世襲（請參閱p33）徒手出門，從者十八人，在福建南安縣安平鎮（今晉江安海，與金門島相望），以「忠孝伯，招討大將軍罪臣國姓」的名義並自籌糧 餉來號召，棹小舟至鼓浪嶼，招集陳輝、洪政、楊才、張進等九十餘人。正愁沒有資金時，有自家船自日本來，成功強命徵取其資金十萬，再分乘二船，到南澳又得 到數千人的加入，佔據鼓浪嶼，攻同安及泉州。
鄭成功派遣林高攜書到日本乞師三千，並欲以平價購買堅甲貳百件。 過去唐王曾命鄭芝龍派使往 日本乞援「…請兵三千，一以聯唇齒之誼，一以報君父之仇，伏仰德威，發兵相助外，緣虜之長技，以箭為先，芝軍因乏堅甲，戰輒受傷因思日國之甲，天下共羡， 以禦弓矢，如金如石，伏懇俞允，准芝平價貿易貳百領。一同大國精兵，前來征戰…」，這個乞師之舉德川秀忠幕府曾加開會議商討其事，後因接長崎飛報，福州陷 清而作罷。其他向日乞師尚有明監國魯王，在一六四八年派馮京第、朱之瑜（朱舜水）等人使日。
鄭成功的初期閩浙沿海各據點，各有其主。而當 時鄭家部隊，除了成功新成立的部隊外，其他仍是沿襲海盜英雄本色型，沒有道義紀律，如成功之堂兄鄭彩魯王封為建國公及定遠侯鄭聯據廈門 ，成功之叔父鄭鴻逵據金門 ，上海壇、南日 、南北二茭、舟山則屬魯王部將周瑞、張振名所守，銅山、南澳為朱壽、陳豹 控制。所以鄭成功的部隊是飄泊於鼓浪嶼、海澄等地。但有堅強的將材如洪政、陳輝為左右先鋒鎮；楊才、丁鎮為親丁鎮；郭泰、余寬為左石護衛鎮；林習山為樓船 鎮；柯宸樞、楊朝為參軍；杜煇為總協理。
一六四七年四月成功復合鄭彩、楊耿等入海澄，破九都，攻漳平、龍巖。七月成功與叔父鄭鴻逵合攻泉 州，敗清提督趙國祚於桃花山。海澄人甘煇，身材五短，猛勇絕群、漳浦人藍登，武藝精熟、南安人施郎 ，機略暢曉並與其弟施顯貴等人投入鄭成功帳下。 一六四八年（永曆二年、順治五年）三月成功統林習山、甘煇攻同安，清守將祁光秋與知縣張效齡棄城，復攻泉 州。 一六四九年鄭成功攻漳浦，下雲霄，抵詔安，移屯分水關。並北聯張名振，南下潮州，向廣東發展。十一月鄭成功入南陽，進勦許隆，克達濠、青林、霞美、 新墟等寨。這兩年南征北討始終在沿海一帶飄盪，而無較好的根據地。
一六五○年（永曆四年、順治七年）鄭成功進師潮陽，知縣常翼風降。回師 時以鄭彩軍出浙江，而金、廈兩島防禦空虛，僅由嗜酒無謀的鄭聯所守而他們仍以海盜方式據地而守，肆虐不堪，民不堪命。 鄭成功依施郎之計，僅以四艦入鼓浪 嶼 ，鄭聯見成功之兵少不疑，是日乃中秋，宴於萬石巖徹夜飲樂，次日成功收編了鄭聯之軍，金、廈回復鄭氏所有，從此鄭成功才算有了固定的根據地。又遣洪政招安 銅山、南澳、閩安諸島，鄭彩之部將楊朝棟、王勝、楊權、蔡新等率全隊水師來降於成功之軍門，此時鄭彩得知鄭聯被殺，但他說：「吾老氣衰，細觀諸子弟，能繼 志者，大木耳（成功字）吾願全師解付」。所以鄭彩將兵船悉數付與鄭成功，因此部隊人數達四萬人，戰艦百艘，也有了根據地金門、廈門兩島。
一六四七年十二月十八日廣西巡撫瞿式耟在廣東肇慶 擁立桂王，並改元為「永曆」。次年鄭成功聞知，乃加額曰：「吾有君矣！」自此奉永曆為正朔。
治軍
鄭 成功他身經百場的戰役，對怯戰者、戰敗者常下令處斬極多。對貪瀆者、叛逆者也殺無赦，並常涉及全家。另一方面對有功者也大大的獎勵並提昇，對有抗爭的城 寨，常施行屠殺。 從一六四九年（永曆三年）九月起至一六六一年（永曆十五年）元月止，鄭成功所誅殺的將吏計有七十五員，這些受誅殺的將吏大都是在作戰時怯戰、戰敗者，黜降 或其他罰責有九員，無分男女老幼全予屠殺的城寨計有八處。另外有六件殺貪誅叛。 如此嚴刑峻罰配合獎勵，同期間對將吏的提昇、獎賞、爵賞，提授計有三百餘員次，而受黜革、降罰、綑責者計僅有三十餘員。 每次獎勵的原因都是戰功，常有人一月數昇，又提昇不拘原有的地位，有一卒因戰功而大大提昇為都督之事實。如此使將士用命，因而有三十員鎮將以上的將領死於 戰場上。同時也使僅佔有金門、廈門彈丸之地而能與滿清週旋十餘年之久。
鄭成功對軍士是以「膽勇為上，束兵次之」的理念來執行，所以將勇兵銳。常有在戰場上以繩索劃地為戰界，退越繩索者誅殺之，畏縮不前、無令後退者亦誅殺之。另一方面對衝鋒陷陣、斬將攀旗之功勞者于以獎勵。鄭成功本人也是勇猛異常，他計有七次在戰場上險遭顯測的記錄。
因 此鄭家軍是「怯者不敢獨退，勇者不敢獨進，膽勇成列，心力俱齊」如此軍威是造成戰場致勝的重大因素。與滿清對峙在金門、廈門時計有四十一次重要的進功戰， 全都由鄭成功親自指揮，計有三十四次勝利、七次失利。其中水戰勝利全屬鄭軍。而清軍占重要的反擊戰十四次。 但卻有十四次派遣兵將遠戍則皆失利。
鄭 氏的軍政分為兩類，一是野戰部隊，即提督、軍、衛、鎮等。另一是鎮守地方官所轄的保安部隊，如忠勇候左鎮等。提督的直屬部隊在原則上有左、右、前、後、中 五鎮。鎮以下為營、翼、司、班、兵。提督為一軍統帥，協理到副統帥。 部隊裝備有盔甲、籐牌、滾被、銃砲、刀斧等。又親軍衛鎮則有收編黑奴為兵的洋槍部 隊，即護衛一鎮，鄭經時期這黑人護衛鎮作為宮中衛隊及僕役用。
海上舟船方方面，明鄭的水師大部使用福船，亦稱大船。這種船「為樓三層，乘風沖擊，不可遏抑，其高若墉 不可抑攻；其堅若鐵石，矢石不能貫，炬不可爇。」其他尚有哨船、鳥船、蒼船、大砲船。
鄭 成功並有自創的五梅花 （請參閱ｐ74）操法，這種操法既通用於陸地，也適用於海上，更適合明鄭所處的地理環境。又鄭成功特重操練，舳艫陳列，進退有法，將士在驚濤駭浪中無異平 地，跳躑上下，矯捷如飛，將帥謁見，甲胄僅蔽身首，多赤腳，有以靴履見者，必遭罵斥，併仰其賞。因海岸多淤泥陷沙，赤腳得免粘腳，往來便捷。
明 鄭在作戰時常用地雷為攻守武器。在北伐以前，鄭清雙方在金、廈外圍計有五十八次的重要攻守戰役，鄭軍占主動的重要進攻戰有四十一次，因所處海陬一隅，不進 一步，即不能退一步的環境。所以以攻為守，以戰養戰。在歷次戰役中有許多厭惡滿清而投靠歸附的兵將，又明鄭的武力是利進，利淺略，不利深進，利乘虛，不利 攻堅，利近守，不利遠守，利於守海，不利守陸，利於野戰，不利於堅壁戰。鄭成功一生好用重兵，甚之時常傾島出師，孤注一擲。
在鄭成功一生中幾乎無月不攻，無日不戰，以進攻代替防禦，有如諸葛亮之六出祈山，以進為守。
周全斌
周全斌是福建同安浯州人，文武雙全，在一六五二年（永曆六年、順治九年）以三策獻給鄭成功，受到賞識提昇為房宿鎮參軍，一六五九年（永曆十三年、順治十六年）六月攻瓜州，周全斌奮勇率兵浮水先登，直衝敵陣，身中五箭，而氣勢越盛，諸軍繼之，於是攻下瓜州。
一 六六○年（永曆十四年、順治十七年）五月清軍出動大軍，李率泰領軍下計有索洪、賴塔、及降將施琅、黃梧等大軍來犯金、廈，風起潮湧，煙燄漫天，周全斌以竹 罌洋砲橫擊之，將黃梧軍全部打垮後，索洪、賴塔見到心寒，棄軍而個自逃命，清軍被焚溺斃數後萬計。以上可知鄭成功所調教出來的兵將，個個以一擋百，英勇異 常，以致閩軍聲名大噪。滿人調來最強的部隊也奈何不了，讓滿人百思不得其解的是同樣是漢人，為何到了福建就完全不同。
廈門失陷
一六五○年（永曆四年）十二月清軍以平南王、靖南王聯合數萬之寇廣州，因而威脅到永曆帝的根據地廣西，永曆帝傳諭旨令希望成功出兵救援。於是次年一六五一年（永曆五年、順治八年）鄭成功奉詔勤王，三月從虎門出兵廣東勤王，這是第一次南下勤王。
令 從叔鄭芝莞守廈門。清福建巡撫張學聖得知廈門防務空虛，命興泉道黃澍、泉州鎮總兵馬得功 來偷襲中左所（即是廈門）。馬得功先集合同安縣十八堡及劉五站全部民社，脅迫仍住安平的鄭芝豹（芝龍弟）派八艘船渡海。 廈門鄭方守將阮引、何德不敵，守 將鄭芝莞得知，席捲珍寶棄城欲遁，如此鄭芝莞怯戰而逃，以致廈門失陷，鄭家積蓄百萬黃金被搶、焚一空。
三月十四日董夫人（鄭成功妻）與世藩鄭經棄其輜重，只攜祖宗神位登船，見鄭芝莞之船吃水深，知船上載有重貨，堅持移乘芝莞之船，表現識大義有膽量。董夫人所懷的神牌即鄭成功之母翁氏（田川氏）。
原 本與永曆帝的晉王李定國 欲會師廣東，如今行抵揭揚，聞廣州已失，又廈門受攻擊。此時鄭成功說：「奉旨勤王，今廈門既破，顧之何益？且咫尺天顏，豈可半途而廢？國雖未報，遑顧家 為？」 這種言論使得軍士哭聲遍聞，於是諸將皆來勸駕回棹，謂「三軍各懷家屬，脫巾亦是可虞」。 如此鄭成功，向南拜曰：「臣冒涉波濤，冀近天顏，以佐恢復，不意 中左失守，將士思歸，脫巾難禁，非臣不忠，勢使然也」，於是回師廈門。
鄭成功兵至廣東揭揚時，以廈門防衛單薄，恐芝莞有失，所以命令鄭鴻 逵回兵助守。 馬得功在大淫掠後，正要離開時巧為鄭鴻達船隊從廣東回師，截斷了馬得功的歸路，鄭成功此時從路陸亦即到廈門，馬得功兩面受敵，就向鄭鴻達威 脅說：「令兄在京、母在安平」。因黃太夫人仍住安平老家，就是在滿清控制之下，鄭鴻逵在親情與國法兩難之中，放了馬得功。此事引起鄭成功對叔父鴻逵的行為 極為憤怒，終生不和鴻逵見面，這也是鄭芝龍投清的後遺症。 鄭鴻逵在兄與侄、民族與家族之間，似乎沒有空間給他，不得已就將所率軍士全給成功，退隱白沙。
鄭成功對這次廈門失陷及復得做出獎懲，取出隆武帝所賜之劍，對失職的叔父鄭芝莞斬於軍門並將芝莞船所藏金銀，搬充軍餉。對有功的施郎賞二百兩銀、加二級，轄將陳勳、鄭文星等賞一百兩等， 于是全軍皆踴躍歡呼。
這就是鄭芝龍投清造成思想分歧，敵我意識迷惑不清，所以行動受制。
另一叔父鄭芝豹卻攜鄭芝龍之妻顏氏到北京降清。
一 六五五年（永曆九年、順治十二年）春，清廷任濟度為大將軍，統兵八萬及漢兵三萬入閩。 六月，鄭軍退出漳州及屬縣，據銅山、海澄、廈門、古雷、游澳，繼續 與清兵對抗。是年鄭成功將廈門之名由中左所改為思明州，以鄧會為知州事，立儲賢館、儲材館、察言司、賓客司，設印局、軍器諸局，令六官分理國事。
廈 門是鄭成功的大本營，因此對環於廈門的地區，北起泉州，南迄潮州視為大本營的前衛站，因此近廈門的同安、長泰、海澄、漳州發生戰役多起。這是一狹長地帶， 隨時可為清軍在任何一處或一處以上的地方切斷。所以大本營的廈門是容易受到攻擊的，在廈門之役後，同年（一六五○年）五月鄭成功伐南溪，十二月伐漳浦，一 六五二年（永曆六年）攻取海澄，降其守將郝文興，進取長泰，五月圍漳州至九月。一六五三年（永曆七年）清軍圍海澄，大戰，清敗退。一六五四年十月攻取漳 州，附近十邑皆下； 一六五五年正月伐仙遊。
鐵人部隊
鄭成功在一六五八年 （永曆十二年）三月在思明集諸將提及去年在護國嶺之役中，殺敗河格商，得其衣甲，全身披掛是鐵，又幼時在日本見到日本武士的重裝備，因而產生一個概念，若 我們的人穿上鐵衣，當會更勇敢。 而有部份將領反對，說那是騎兵的裝備，因鐵甲重達三十斤，如何在戰場上，進行追、退，行動因而受制。但甘煇提出解決方 案，只要平時在兩腳上綁上沙袋來操練，久了就不怕重。
因此鄭成功下令製造被掛、鐵面等裝備。又在演武亭 設一大石重三百斤，將選中者，由鄭成功親自檢閱，令他提石繞行三圈。當場合格者五千人組成「左右衛武親軍」，號稱「鐵人」。 每人月給銀三兩，有功者擢為營將。令左虎衛鎮陳魁統之。
戴 鐵面、穿鐵裙，臉上繪有彩色彪文，其後徵得萬人，刀槍不入，常居軍隊之前鋒，執斬馬大刀，敵人皆以為是神兵，此鐵人部隊專門對付滿人之騎兵，及其他艱難的 戰役。在第一次與清軍對陣時，清軍看了就怕。 在攻台之役中，荷蘭人見到了鐵人部隊，十分懼怕國姓爺，對鐵人部隊的壯盛軍容荷人對鐵人繪有圖像。他們的述說是：「…他們（指鄭成功）的兵士有三種武器； 一部份的兵有弓箭掛在背上，左手執盾，右手拿很重的劍；另一部份士兵則兩手拿著長木棍，木棍上有彎刀；所有的兵，除兩臂和腳外，全身有鐵甲保護，上面有 魚鱗似的鐵重疊…以盾牌作掩護向敵人衝鋒，穿入敵人陣中，勇猛無比，彷彿另有一個身體放在家裡似地，拚命地前進，雖然有許多人被打死，他們也簡直不管，像 瘋狗似地猛撞，也不回頭看…」 此處所說的盾即是藤牌，很重的劍就是雲南斬馬刀。
對鐵人部隊的裝備在從征實錄的記載是：「設戎旗左右鎮，以林勝為左戎旗鎮，拔左衝鎮楊琦為右戎旗鎮，調各處鄉勇訓練銃器，配執銅百子花釬銃，設斬馬刀，不空歸木棍，每名兵另帶銃彈三粒在身，遇敵擲擊。」
藤牌部隊
鄭 成功的武力有先進的船隻、大砲、武器等，其中藤牌部隊使得擁有鐵騎的滿州兵吃盡苦頭。 藤出產在福建，以藤來做盾牌則質料輕，攜帶及使用方便，成本比起皮 革低甚多。另一個優點是利於涉水，用油浸透過的藤牌，除了能能抵禦矢石、銃彈外，其浮力大，使渡水時不必耗力泅水。 藤牌兵多與緬刀 、雲南斬馬刀配合使用，所以「刀」、「牌」並稱。
在鄭成功最精銳的部隊就是由「戎旗鎮」擴編的親軍四鎮，即武衛左鎮，武衛右鎮、虎衛左 鎮，虎衛右鎮。在成立親軍各鎮的「鐵人」部隊時，其部隊的編制是「每班帶班長六員，配雲南斬馬刀各二，牌、?各二，弓、箭則全班俱執。又十班之中，弓箭居 四，刀、牌居六。」 身著三十斤重鐵甲的鐵人部隊在渡河作戰即是靠此藤牌。 作戰時用藤牌擋住了清軍的弓箭，滾地至敵陣，專砍馬。因此懂得使用藤牌者，使 之陷陣、摧堅，十可當百。
鄭成功的部屬，無論官、兵，人人都善用藤牌，通常藤牌之數量是與神機銃器相等。
藤牌戰法大約可分為六種：
一． 滾向敵陣，專砍馬腳。
二． 在砲矢攻擊下，以牌掩護登城。在海戰中跳至敵艦亦同。
三． 以二人、三人為一組，一位舉牌作掩護，其他人作戰殺敵。
四． 以眾多的藤牌結陣護身，團體直接衝入敵陣。
五． 藤牌厝 戰法，即以眾多藤牌相連成屋而進攻。又稱「圓陣戰法」常對付滿清騎、射見長的馬隊。
六． 大帽子戰法（請參閱ｐ88）
「明 季南略」書中對鄭軍在北伐時的述說是：「…前隊長鎗，次團牌，第二陣『倭銃 』…而疾走如飛，突至馬前殺人。其兵三人一伍，一兵執團牌，蔽兩人，一邱斫馬，一兵砍人，甚銳，一刀揮鐵甲軍馬為兩段。蓋鑄刀時，用鐵匠百人挨遞打成此一 刀，故銳特甚…鄭兵不動，俱銕甲胄銕面頭子，只露兩足，用長刀砍騎，銳不可當，射中其足，則拔箭更戰，清兵逐敗…」 此處所說的團牌即藤牌，並有鐵人及藤 牌的使用。 「第一隊五十人，前有五色旗一面領之。有滾被二人；滾被者，用一大棉被厚二寸，一人執之，雙手有刀。如箭至，即張被遮候； 箭過，即捲被持刀 滾進，斫人馬足，又有團牌二人。滾被、團牌此四人俱喫雙糧。」
鄭成功在看到自已所訓練培養出來的鐵人、藤牌部隊時，曾很興奮地說：「似此可以縱橫天下矣！」
閩 粵沿海諸縣，自明朝嘉靖年間（即一五二二年至一五六六年），受到海賊、倭寇的蹂躪，也就是百年來明朝政府無能來保護人民，則人民自行武裝，故民間極為尚 武，以求自衛。通常是以家族為一戰鬥團體，又因如此，家族觀念較其他各省強烈，經常可見一二在外有成就的家族成員，則全家族的青壯都前往依附。如鄭芝龍成 為海上巨寇後，舉族弟兄子姪全都來依附。又因此軍隊的主將與官兵之間也產生了如主人與家丁的關係。就是這家主人換了第二代，則家丁當然追隨少主，這種關係 延伸到了軍中。如施天福原為鄭芝龍之部將，鄭成功起兵後即毫不猶疑地靠過來追隨鄭成功。
施琅叛逃
施琅（一六二一 至一六九六），福建晉江人。原名郎，降清後改名琅，年紀與鄭成功相仿，鄭成功起兵後與弟施顯、及甘煇、金裕、林壯猷等來投效。被提拔為左先鋒鎮。他體型魁梧，有軍事才華，智勇兼備，每戰英勇，卓著戰功，但恃才而驕。多次戰役有勇有謀，但與同僚相處不睦。
在 一六四九年（永曆三年、清順治六年）十一月，潮州之役，陳斌是潮州人，十分勇武，其手掌有常人二倍大，人稱大巴掌，熟悉當地形勢，鄭成功的這次攻潮州作戰 策略就是依其意見優先。這件事使恃才而驕的施郎不滿。又成功命施郎先斷橋，但施郎卻與清軍對敵三日不下，成功說：「諒一橋難拔，尚能圖大」之譏語，感到恥 辱，而對主攻潮州的陳斌發生不睦，引起陳斌他去，將才因而流失。又為細故率數員至大將黃廷行營辱罵，並打毀家具，成功戒之。二年後鄭成功不顧局勢險惡欲南 下勤王時，施郎反對，並以托夢為辭勸阻，成功惜其才華，僅被解除左先鋒之職，將兵權交由副將蘇茂代管，遣回廈門閒居。
一六五二年（永曆六 年）有一位原本是施郎部屬的親兵曾德，他逃出施郎後，加入成為鄭成功的親隨。有一天為施郎捉住，並準備給予懲罰，此時鄭成功下急令不可殺曾德，但持才倨傲 的施郎不理會上級的命令，將曾德處斬。此事令鄭成功極為憤怒。又施郎四處發出怨言，毫無忌憚。於是在四月二十日下令逮捕施郎、其弟施顯及父施大宣，以便處 以懲罰，並全都被捕獲。將三人全交給林習山囚在艦上，林習山下令由副將吳芳看管。施郎當夜有訪客，客走後以很興奮的話語說鄭成功只要他賠鎧甲，而非取其 命，這樣的言論來騙吳芳，如此施郎單獨逃出，置其父、弟於不顧。 鄭成功得知下令殺施大宣及施顯。施郎逃至他的副將蘇茂家住二日，蘇茂以小船將施郎送到安平，投靠鄭鴻逵，隨後就向滿清投降。
在一六五七年 （永曆十一年、順治十四年）九月陳斌等死守羅星塔，此時施琅為報復以前與陳斌不睦，就請清總督李率泰派人誘使陳斌投降。陳斌投降後全師到福州，由清總督李 率泰依名冊頒賞千人，五人一組，從東轅門入，由西轅門出，一一繳械。梟首 千有餘人。斬訖，再收陳斌殺之，施琅達成公報私仇。
黃梧叛變
黃 梧福建平和人，一六五一年（永曆五年）來歸海上，六月成功撥為中權鎮副將，八月陞為英兵營，多次戰役均無顯著戰功，但又被陞為前衝鎮。在一六五六年一月清 尚可喜兵窺揭陽，左先鋒蘇茂（請參閱ｐ16）欲出兵而戰。金武鎮郭遂第對當時的地形提出疑問：「列陣過橋，勝則猶可；倘若少怯，其橋又狹，難以退，其將如 何？」 黃梧曰：「戰則必勝，何用退兵。」 這番建言使得蘇茂喪師五千餘，有促成損將折兵之罪責。 黃梧是一位在軍事上無長才，智勇不備，無戰功，卻造成 喪師之人。在戰後的賞罰中，蘇茂因揭陽喪師被殺，黃梧、杜輝以應該支援而卻退卻，杜輝綑責六十棍，黃梧記責，各戴罪圖贖，但軍職依舊，若再犯二罪俱罰。事 實上黃梧有三百多名鐵人部隊（請參閱p13）在此役中喪生，但是來點驗人員同意以他鎮的鐵人部隊來應點，鄭成功因見到其兵甲無失，而未殺黃梧。此後黃梧日 子過得心驚膽顫，生出了降清的念頭。
滿清貝子得知鄭成功的軍令如山，而黃梧揭揚喪師心生恐懼，向黃梧誘說。事有湊巧，海澄守將王秀奇到廈門開會，將海澄防守之責暫交黃梧，黃梧得此機會，向滿清閩浙總督李率泰通知欲獻海澄，滿清以馬得功來接應。同時也誘騙蘇茂之弟蘇明降清。
一六五六年（永曆十年、清順治十三年）六月二十二日，前衝鎮黃梧殺總兵華棟，率副將蘇明、鄭純，官員八十六員及士兵一千七百名，將海澄獻給滿清。
鄭成功大部積蓄都存在易守難攻的海澄，全部都送給了滿清，損失極大，計有「糧粟二十五萬石、軍器、衣甲、銃器無數」，及各將領的私蓄。海澄是金門、廈門最重要的外圍據點，失去了海澄後即失去了金廈的屏障。
失 去海澄後的鄭成功嘆曰：「吾意海澄城為關中河內，諸凡盡積之，豈料黃梧如此悖負，後將如何用人！」。海澄的失去對鄭氏抗清而言，又延緩北伐的時間，以致在 羊山遇颶風之重大損失，更失去運用西南李定國抗清的時機，使清軍無法兼顧。後鄭成功圍攻南京，滿清即是運用征西南凱還之師，來解救南京之圍。
平海五策
黃梧的叛離向滿人投降，為買歡滿人，力向清廷奏請堅壁清野提出了「平海五策」，以斷絕鄭成功從海上獲得接濟，其內容如下：
一． 鄭氏在金廈兩島彈丸之區，得以延至今日而抗拒者，實在是由於沿海人民走險，將糧餉油鐵桅船之物供應。為今之計是將沿海省份山東、浙江、福建、廣東，四省將 沿海三十華里（一華里為五百七十六公尺）的居民全部遷徙入內地，不允許人民居住在沿海地區，並設立邊界佈置防守，如此鄭成功則不攻自滅也。
二． 將所有船隻，全部燒燬，寸板不許下海，凡溪河樹立椿柵，貨物不許越界，時刻瞭望，違者死無赦，如此半年鄭氏的海師船隻，無可修葺自然朽爛。此所謂不用戰而坐看其死也。
三． 鄭成功之父鄭芝龍雖然在京受押，但鄭成功賄賂商賈，南北興販，時通消息，宜速究此輩，嚴加懲冶貨物入官，則交通可絕矣。
四． 成功之祖先墳墓在各處，叛臣賊子罪誅及九族，何況其祖乎？應加以遷毀，慕露殄滅，使其命脈斷，則種類不待誅而自滅。
五． 投誠兵官散住各府州縣，虛靡錢糧，倘有作祟又貽害地方不淺，可將投誠官移住各省分墾荒地，不但可散其黨羽以絕後患，又可建設。
這個平海五策清廷准奏並派遣兵部尚書蘇納海，到福建推動，下令上自遼東半島南至廣東，所有居民遷入離海三十華里之內陸，對使得沿海居民，數百萬戶跋涉離鄉，顛沛流離，怨聲載道，苦不堪言。
當時滿清官員湖廣道御史李之芳也發出異聲「自古養兵，以衛疆土，未聞棄疆土，以避敵者也。」並舉出不可之理由：
１． 何以垂訓後世？
２． 廈門乃彈丸之地，不思征討，遽遷以避，其如天朝體統何？
３． 沿海是我赤子，一旦遷之，室家靡定，或浮海而遁，去此歸彼，是以民予敵。
４． 欲遷沿海一帶，當日出示，諭限數日，官兵一到，遂棄田宅、撤家產、別墳墓，號泣而報，是委民於溝洫也。
５． 遷移之民貧者不過數日之糧，富者亦但數月之儲，逼處內地，無家可依，無糧可食。餓寒逼而奸生，不為海寇，即為山賊。一夫持竿，四方響應，其若之何？
６． 今五省之民沿海已居其半，當道者不思制插安民，只欲盡以遷移，能使賊自斃乎？
７． 江南魚鹽，為富強之資。魚鹽之利何啻千萬？土產之物，百倍其利。此項年例解京，從此而止。
８． 今兵不守沿海，盡遷其民，移居內地；則賊長驅內地，直抵城邑，其誰禦之。
如此鏗鏗之言不能打動清廷，但是滿人深信遷界海禁是「不用戰而坐看其死」
在一六六○年九月，閩督李率泰奏請「遷界」，將同安縣、海澄縣開始實施遷界。
三、四兩策是針對鄭成功所施行的攻心毒計，其父被磔 於燕市，祖墓全部被掘，暴露殄滅，最剌激鄭成功。第五策在明鄭滅亡後對投降官兵徹底實施。這五策成為滿清對付鄭氏王朝的指導原則。
黃梧的平海五策外，尚附有二小項是「收拿五商（請參閱ｐ51）、沒收鄭氏田產（請參閱ｐ82）」
到 了一六七四年（永曆二十八年、康熙十三年）耿精忠反清，此時在漳州的黃梧（滿清所封的海澄公）轉降耿精忠，剪辮，耿精忠封黃梧為平和公，不久背生疽病亡， 由其子黃芳度襲封位，耿精忠就徵調漳州兵並任命劉豹守漳州。次年一六七五年在鄭經反攻大陸時，黃芳度與耿精忠不合，耿氏再度入兵漳州。黃芳度轉向鄭經投 降，卻又暗地與滿清交通。鄭經自泉率師路過漳州，黃芳度不敢來謁，禮官鄭斌受命入漳慰諭或率兵從征，或束身入覲，但黃芳度不受命。叛變之形呈於表面，鄭經 圍攻漳州，十月漳州副將吳淑，開門迎鄭經。黃芳度投開元寺井而死。鄭經開黃梧棺，戮屍，再斬黃芳度首懸掛於木桿上示眾。
在施琅、黃梧降清之前，鄭成功的將領只有殉職盡節，捐軀報國，戰死不屈之將軍，而無賣主求榮，附敵投虜之降將。施琅、黃梧甘於認賊作父，毫無民族意識為後人稱之為漢奸。滿清利用此二人分別向鄭氏將領招降。
施 琅、黃梧並常藉各種理由設計分化鄭氏將領，引誘銅山守將蔡祿、郭義叛鄭，又造謠南澳陳豹有貳心，達成鄭氏內部分化。 鄭經即位時的王位爭奪是一個製造分化 的大時機，各種正間、反間、謠言、引誘來達成明鄭內部的分裂。例如鄭泰（請參閱p35）之被殺，雖無明顯直接明証是黃梧、施琅之輩所為，但造成的傷害是無 法彌補的。
漳州、海澄二役
一六五二年（永曆六年、順治九年）鄭成功正月攻海 澄，二月攻長泰。從四月鄭成功兵圍漳州城，清福建巡撫陳錦前來救援，與成功相戰不利，退至同安之鳳尾山。在鳳山尾陳錦鞭笞其奴庫成棟，是夜庫成棟攜匕首刺 殺陳錦，割其首，前來鄭營獻首。鄭成功雖然賞其功，但也感既而說：「僕戕主而赦之，是天下無刑也！」 所以賞後，將庫成棟以叛主之名殺之。 陳錦這支軍因無主，故星散回汛。滿清派出浙鎮馬逢知率兵援漳，成功將計就計，讓馬逢知輕易入漳州城。入城之後方知成功之計策是讓城內多添人馬，糧食容易消 耗，若外部救援不及，則內部必然窘促，破城之日就近了。
漳州被圍於是清巡撫宜永貴採用圍魏救趙之法，集二百餘艘船出兵攻打成功的基地廈 門，以解漳州之圍。成功令甘煇率水師禦之，二軍相遇在崇武，甘煇大勝。到了八月築堤鎮門山，以水灌漳州城。 城內人口多，但無蓄糧，況且兵多，糧食食盡，兵奪民食，人民不敢舉煙，煙一出即知此屋灶上有物，則兵即來搶，金珠寶玩，賤如瓦礫，紙皮樹葉，亦成為糧，弱 肉強食，死亡塞戶，人食人。
九月金礪 （又名金固山，是滿州八旗的都統，滿語叫《固山額真》，當時便稱固山）與新總督劉清泰再增兵來救援漳州，然後才解漳州之圍。總計半年間有十萬軍士陣亡，沉 船千艘，漳州軍民餓死達三成，死於路上也有七成，戰後挖三大穴，穴前各立一碑，即「同歸所」、「萬安所」、「萬公所」來容納遺骸，軍民總共死亡人數達七十 三萬人。
由清將金礪固山對成功發動攻擊，解除漳州之圍後，雄心大發想一氣盡吞中國南部。於一六五三年（永曆七年、順治十年）四月進兵鄭成 功所佔的海澄，進行海澄攻防戰。清水師出福、興二港夾擊鄭成功。五月一日成功自率大隊至海澄，令王秀奇、郝文興、陳堯等守鎮遠寨，甘煇、黃廷守關帝廟，為 指揮順利，在海澄天姬宮前築將台，親登觀兵督戰。五月八日金礪全力攻鄭，砲聲震天城垣隨壞隨築，鄭成功坐將台，張蓋指揮。金礪望見傘蓋，令大砲對準傘蓋所 在的將台齊轟。諸將見砲如雨下，勸成功下台避之。但成功就是不肯，甘煇見狀不顧身份，強行將成功掖下脫離將台，剛一離台，其座椅已遭砲擊碎矣。 七月海澄 城壞百餘丈，而成功指揮自若，敵攻未逞，雙方激戰，成功設下地雷陣，一聲霹靂燒死清軍無數，金礪固山敗退回漳州。 清廷以聖旨將滿清最猛戰將金礪固山招回，以免造成更大的遺憾。
十月在清的統治下漳州有樓總劉國軒私自到廈門，先見參軍馮澄世 ，馮澄世與劉國軒長談後甚為器重。劉國軒感知已故拜馮澄世為義父。經馮澄世引見鄭成功，成功對劉國軒想來投靠頗感欣慰。十一月初一鄭成功驅軍至漳州，國軒開門降鄭，於是漳州入鄭成功之手。
南下勤王
第一次南下勤王是在一六五一年正月成功應西寧王李定國之請，至南澳備師，南下勤王。忠勇侯陳豹請見，他向鄭成功說明南下勤王不應由鄭成功親自率領，而他願意率同各鎮南下，詣會王師，若有消息，再請成功親自南下不遲。然而鄭成功認為，身受皇恩，當自率軍前往。
二月率軍至白沙湖，二十五日忽狂風大作，三月至大星所，攻克。此時福建巡撫張學聖、提督馬得功等齊攻廈門。（請參閱ｐ10廈門失陷）所以回師廈門，以致此南下勤王中途而廢。
第 二次南下勤王是在一六五四年（永曆八年）成功遣池士紳攜奏章由陸路赴安隆所（請參閱南明四王位置圖p4），向永曆帝奏明擊退清軍經過，帝爵封成功為「延平 郡王」，招討大將軍，以六部郎中各一員隨師紀錄，賜尚方劍便宜行事，甘輝為崇明伯。四月李定國分兵復定羅定、新興、石城、電白、陽江等縣。遣使約鄭成功共 取廣州。使者攜帶厚禮四色，與鄭成功議子女聯婚。
鄭成功因有前車之鑑（廈門失陷），不能親自領軍勤王，而令左軍輔侯林察為水師總督，提調 軍中一切事宜。 委右軍閩安侯為水師統領，戎旗勳鎮王秀奇為陸師左統領，左先鋒鎮蘇茂為陸師右統領，率兵數萬、戰艦百艘，是年十月十九日出師，再次南下勤王。先差效用官林 雲璿送勤王奏章到廣西給永曆帝，也同時作書知會晉王李定國（請參閱ｐ11註）。並攜帶十個月份之糧食，準備長期作戰。
可惜林察之軍行至廣東虎門時，李定國之軍是以陸師為主，在鄭成功南下勤王之師到達前，便逕自出兵進功新會，以至一戰盡失，敗走南寧，退回梧州。因此林察勤王大軍無法會師。一六五五年五月大軍回到廈門。這是第二次勤王之師又是無功而返。令鄭成功十分失望。
二次北伐
鄭 成功的軍力極強，但連年征戰，土地佔領快但也常常失去。自起兵以來七年間所攻佔的據點如：漳州、海澄、仙遊、羅源、寧德等到後來均不得不放棄而退回金門、 廈門。對此鄭成功詢問潘庚鍾、陳永華二位參軍。得到結論是「以強勢而行動敏捷的水師北伐，破崇明瓜鎮而入，直取南京，南京若得，則中原豪傑，以及川、湘、 黔、閩、浙、贛等，也會響應，則江南垂手可得，中興有望！」
北伐的另一重要原因是要解除在南方永曆帝的困境，永曆帝在一六四九年（永曆三年）春時在廣東肇慶，次年十一月遷至南寧。永曆五年至十年在安隆所，一六五七年（永曆十一年）卻敗退至雲南。若北伐將減輕清軍對永曆帝的壓迫。
一 六五八年（永曆十二年、順治十五年） 五月鄭成功率十七萬大軍，水師、騎兵、步兵各五萬人，另有二萬人機動配合作戰，其中鐵人部隊萬人，以黃廷為前提督，洪旭為兵官，鄭泰為戶官，留守廈門，而 自率甘煇等北上。 又會合魯王的兵部右侍郎張煌言（即張蒼水）、張名振大舉北伐，女眷亦隨軍出征，董夫人及鄭成功的妾媵諸子等。 六月十三日大軍出動，「連檣八十里，見者增慄」陷平陽、瑞安。七月三十一日（陰曆七月初二）抵舟山，以風信不順，即駐紮。九月七日（陰曆八月初十）艦隊北 到羊山 時，颶風怒發，碎巨艦百餘，漂沒士卒八千餘人，鄭成功廢然而返，此為第一次北伐。此役鄭成功之妾有六位 及四子鄭睿、七子鄭裕、八子鄭溫均被淹死 。
第二次北伐是在一六五九年（永曆十三年、順治十六年）又率十七萬大軍北伐，五月從舟山出發，五月十三日（陰曆）抵崇明，諸將建議先取 崇明為老營，但沒採用。由崇明入長江，七月八日（陰曆六月十九日）扺吳淞口，重申約法，「以得民為本」，這次鄭成功有必勝的決心，先奪南京，以為根本，所 以各將領均攜帶家眷同行。鎮江至瓜州十里，清用巨木築長壩，截斷江流，廣三丈，覆以泥，可行馬，左右木柵有穴，穴中有砲可射，砲石盤銃，星列江心，用圍尺 大繩，牽接木壩兩端，以拒海舟。鄭軍先以四舟揚帆而上，海舟既上又下，反復數次，清兵對鄭舟猛發炮如此五日，不傷一舟。八月三日（陰曆六月十六日）鄭軍破 瓜州，清馬兵來援，鄭軍立於水田中，砍馬足，大敗清馬兵。從南京發出清軍，由洪承疇麾下羅將軍鐵騎千人赴援，其兵鐵甲如雪。羅將軍管提督等兵，共九隊，凡 一萬五千人，而馬居半，京軍憍躁，急欲與戰。鄭軍以海舟忽進忽退，清軍馬在南則鄭艦泊于北，清軍移駐北則鄭軍泊于南，清兵逐之三日夜不息，疲之。鄭軍以藤 牌兵及鐵人部隊即全步卒以應，清馬兵至，鄭軍嚴陣以待，屹立不動，俱以團牌（藤牌）自蔽，望之如堵。清軍三卻三進，鄭軍如山。突鄭軍疾走如飛，突至馬前， 殺入。三人一伍，一兵執團牌蔽二人，一兵砍馬，一兵砍人，刀極銳，一刀揮之鐵甲軍馬切為二段。又有砲居於後，突發砲，清軍被擊斃千餘人。
八月四日奪木浮營 三座，滿清又於金山、焦山兩之間以鐵鍊橫斷江，謂之「滾江龍」，周全斌、張亮、陳大勝令善泅者十餘人，將鐵鍊斬斷。 九日陷鎮江，控制了南北咽喉。滯留五日。
此時甘煇建議：「斷瓜州，則山東之師不下，據北固，則兩浙之路不通，南都可不勞而定矣。」，可惜未能採用。 八月二十六日（陰曆七月初九日）大軍抵金陵，行軍之緩因大雨阻途，由鳳儀門登岸。八月二十九日（陰曆七月十二日）成功率諸文武遙祭明太祖陵。
此 時明魯王之兵部右侍郎張煌言也由蕪湖出兵，取徽州，已得四府（太平、寧國、徽州、池州）、三州（和州、廣德、無為）、二十四縣（當塗、蕪湖、繁昌、宣城、 寧國、南寧、南陵、太平、旌德、涇縣、貴池、銅陵、東流、建德、青陽、石埭、巢縣、含山、舒城、廬江、高淳、溧水、溧陽、建平等）。 此時江寧空虛，清軍 松江提督暗地向鄭成功洽商投降條件，致使鄭成功兵圍南京，而擁兵觀望，等清軍八十三營前來投降，局勢一片大好。 當大軍到達鎮江時，江北各縣民眾即綵旗羊 酒前來勞軍，大軍抵南京時就有人來洽降；張煌言部隊到距離儀徵尚有五十華里時，民眾就列隊在城外歡迎。江西、浙江、湖北、山東、河南諸省的民眾自動投奔帳 下，願為志願軍，整個東南已大為震動，並且延及黃河下游與長江中游。
在「明季南略」有段說明戰事：「…（清）兵馳騎突前，鄭兵嚴陣當之，屹然不 動，俱以團牌自蔽，望之如堵； 大兵三卻三進，鄭陣如山。遙見背後黑煙冉冉而起，欲卻馬再衝；而鄭兵疾走如飛，突至馬前殺人，其兵三人一伍，一兵執團牌蔽 兩人，兵砍馬，一兵砍人，甚銳，一刀揮鐵甲，軍、馬為兩段。」（請參閱ｐ14藤牌部隊），時在北京的順治皇帝得知南京將陷，欲逃回滿州。
此時鄭成功作詩一首：
縞素臨江誓滅胡，雄師十萬氣吞吳。
試看天塹投鞭渡，不信中原不姓朱！
清 軍守將郎廷佐聞鄭軍將到，將城外房屋全部燒拆，城外十里之內，所有居民全部搬入城。七月八日（陰曆）鄭兵到。郎廷佐使拖延計，他向鄭成功傳話希能在三十日 後投降。鄭成功當時驕盈，他的見解是「自舟山興師以來，戰必勝，攻必克，彼焉敢緩我之兵邪！攻城為下，攻心為上，今既來降，驟攻之，何足以服其心哉。」 同時也不想犧牲軍士，為此中計，在此之前也沒有採用甘煇的建議～留兵鎮江嚴扼咽喉，使得滿清援軍順利到來。 而成功以有令「軍無令，不許輕戰」，九月八日 （陰曆七月二十二日）清軍乘鄭軍疏於戒備時，突出猛襲。次日各路潰敗，大將甘煇、萬禮、林勝、陳魁竟為清援軍梁化鳳擊敗，甘煇被執不屈而死，鄭成功悔之晚 矣。黃安斷後，保全諸軍回棹，殘軍出海，兵員損失約十分之六、七，戰將喪失十二人，張英、甘煇殉職。損失極大。收拾殘兵十得二三而已，成功欲自殺以謝死 者，周全斌等諸將泣諫而止。十月退回到福建金門、廈門，結束了第二次的北伐。建忠臣祠，以甘煇為首。
另一方面張煌言聞鄭成功兵敗南京，欲進入江西，但也為清所敗，僅以身免。
北伐之失敗，鄭成功快速退卻，是因水師不能在陸地作持久戰，辛苦得來的城鎮即棄之，引起原先支持復明者，事後清軍的清算，飽受清吏荼毒殺戮之苦。
清軍再犯廈門
北 伐失敗引起清軍再次覬覦鄭成功的根據地金、廈兩島，一六六○年六月十七日（陰曆五月初十），清安南將軍達索 率二十萬滿漢大軍，這是一場滿清志在必得的戰役，又會同總督李率泰、碣石總兵蘇利、南洋總兵許龍、饒平總兵吳六奇等數路部隊，集水師叛將黃梧從漳州，同安 總兵施琅從同安，大舉進攻廈門，謀一舉根本鏟除鄭氏。 成功曉諭廈門兵民婦女，撥水師洪善等船盡載過烈嶼、金門，而空廈門，這是一場生死存亡的戰爭。
僅留黃安部仍守新城兼防廈門全島，鄭泰從浯嶼（金門）率兵船迎擊來自廣東清軍，鄭成功自率大軍對付漳州來軍，陳鵬守高崎迎擊來自同安的敵人。
中 午鄭成功親率巨艦衝之，又有鄭泰自浯嶼合攻，清軍受擊敗退。 但鄭方的陳鵬暗中與敵對的施琅勾結，預備為清軍內應。清軍在達素、施琅統率的同安船隊，就大大方方地向陳鵬轄區下船涉水而來，惟副將陳蟒並無與清勾結，見 敵皆已棄船登岸，勢急，不俟號令，急急發令發砲迎敵，大破清軍，死者十之七八。 成功利用風勢、海潮以巨艦向敵衝擊，清兵多北方人，不習水戰，被鄭軍斬殺殆盡。 施琅與達索駕小船逃走，清將呂哈喇被殺，死千餘人，僵屍布滿海面，損兵折將，達索返福州後，懼怕上級的譴責，羞憤吞金自盡。這一役鄭方斬及俘獲極多亦有不 少滿人。
清廷對付鄭氏，欲剿不能勝，欲撫不能成，因此體驗到用兵不能解決問題，而鄭成功又視陸上徵糧為要政，於是走入讓漢民族痛苦亦常，沿海五省實行慘無人道的「遷界」，欲使鄭軍斷絕沿海人民的支持。
雖然在這場金、廈防衛戰中大獲全勝，應可再攻清軍。但本身的人力、物力在北伐中已消耗無存，不堪再戰，況且閩浙沿海連年征戰，哀鴻遍野，十室九空，不堪再戰。
打敗荷蘭人，佔領台灣
鄭 成功在逐鹿中原失敗後，深受影響，為保証能中興明室故將眼光看到台灣。一六五六年（永曆十年、順治十三年）鄭成功對在台灣的荷蘭人及在呂宋 的西班人不滿而發佈海上貿易禁令，並徹底執行。次年荷蘭駐台長官揆一（Frederick Coyett）深受禁令之苦，故派漢人通譯何斌 （右圖）來到廈門，並以年輸餉銀五千兩（三百十二．五台斤重）、箭柸十萬枝、硫磺千擔等要求開放通商。何斌乘此機會向鄭方提出取得台灣之利「田園萬頃，沃 野千里、餉稅數十萬」，並附上航海圖。
鄭成功北伐失敗後僅存金、廈二地，土地狹小，在糧食不足，又保持家屬安全上頗多困難，雖清軍達素的 攻勢失敗羞憤吞金自盡，但滿清船隻、兵員損失無幾，隨時都有可能捲土重來，鄭軍都在極度戒備緊張之中，如今得知「田園萬頃，沃野千里、餉稅數十萬」甚為心 動。所以其自救之道即轉向為攻取台灣不失為反清復明，立萬年之基必行之路。
一六六○年六月鄭成功在思明州準備攻台，下令大修船隻，聽令出征。召集幹部黃旭、馬信、黃廷、王秀奇、陳煇、楊朝棟、林習山、吳豪、馮澄世、蔡鳴雷、薛聯桂及陳永華等人開會。
徵 詢部屬的意見並說出自己的看法：「天未厭亂，閏位（清帝）猶在，使我南都之勢，頓成瓦解之形，去年雖勝達虜（達素攻廈門）一陣，偽朝未必遽肯海戰，則我之 南北征馳，眷屬未免勞頓。前年（一六五九年）何斌所進台灣一圖，田園萬頃，沃野千里，餉稅數十萬，造船制器，吾民麟集，所優為者，近為紅夷占據，城中夷 夥，不上千人，攻之可垂手得者，我欲平克台灣，以為根本之地，安頓將領家眷，然後東征西討，無內顧之憂，並可生聚教訓也。」
大體上 「北將」（清將來降）主張攻取台灣，而「南將」（漳、泉子弟）卻是反對東征，因為台灣是海外之地，不是反清復明的目的地。 究其因是鄭軍的特色是亦兵亦 商，它是繼承海上及鄭芝龍以來的傳統，縱橫海上的霸主即是商船隊之盟主，因此南將亦兵亦商頗有積蓄，也因此較有安逸之心，對離開漳、泉這穩固商業基礎是反 對的。如宣毅後鎮吳豪他曾到台灣，就說：「港淺大船難進，且水土多瘴癘。」因此這次會議是沒有結論。
同時外來的反對言論如張煌言（請參閱ｐ21）他認為怎麼可以放棄閩浙千萬生靈，而只去攻佔一個島？若取台灣島則金門無法守，失去了金門就失去了天下人心。就做了一首譏笑詩：「寄語島上避秦客，衣冠黃綺總堪疑。」
次 年一月，即六個月後鄭成功得知在台灣的荷蘭人，因懼怕國姓爺，而從巴達維亞所派來的援軍，見無戰事而撤返巴達維亞。 此時機會成熟成功再大會文武官員，雖 有宣毅鎮吳豪、前提督黃廷出言反對，但仍有建威伯馬信及陳永華的支持。鄭成功決意親征台灣，行前表文告說：「本藩矢志恢復，切念中興，恐孤島之難居，故冒 波濤，欲闢不服之區，暫寄軍旅，養晦待時，非為貪戀海外（指台灣），苟延安樂。」
一六六一年（永曆十五年、順治十八年）四月二十一日（舊 曆三月二十三日）中午，鄭成功起兵二萬五千人、船隻九百艘攻台。船到澎湖即發生糧食不足的現象，鄭成功下令就澎湖三十七島取行糧，得到回報是：「各嶼並無 田園若種禾粟，蕃薯、大麥、黍、稷、斗升湊解，合有百餘石，不足當大師一餐之用」。 以致在風雨中鄭成功下令航向台灣。他當時說：「冰堅可渡，天意有在。 天意若付我平定台灣，今晚開駕後，自然風恬浪靜。不然，官兵豈堪坐困斷島受餓耶？」
鄭成功的部隊一上岸即將荷蘭軍打得落花流水，西方人記 述鄭成功的軍隊是：「國姓爺的軍隊中有弓箭兵，以對抗荷人的槍兵，又軍隊中有鐵人軍，每一人著鐵製的鱗甲，包住全身，鐵片長度可掩住膝蓋以下，以保護到兩 腳。這是一個武裝齊備的軍隊，他們與Thomas Pedel 的戰鬥中，無視洋槍隊的威力，沒有一個人將死亡擺在心上，勇猛無比，不管周邊有許多人被打死，照常像瘋狗似的前撲。況且他們也有相當多的重砲及充足的火 藥。」這是黃種人第一次向歐洲白人爭奪殖民地成功的例子。
登陸不到一個月，實際僅二十四天即佔領全台灣，僅留下「熱蘭遮城 」（ZEELANDIA），鄭成功十分有把握，看輕荷蘭人，也不急攻，留下一小部份軍隊包圍即勇衛、侍衛兩鎮，圍困等待荷蘭人自動來降。鄭成功指示 台灣 （指熱蘭遮城）孤城無援，攻打未免殺傷，圍困使其降；隨將各鎮分派汛地屯墾，派提督馬信督轄兵札台灣街守困之。 這個作法也兼顧軍士的生命，荷蘭人遲早要 降，也不急於一時，展現出大仁之心也。
其他來台軍隊在登陸後的第十八日，鄭成功就頒布屯田令諭，全力投入開發、生產。如此為徹底解決糧食問題，又可安頓軍隊及其眷屬。
荷人在海戰、陸戰上皆輸因而投降。
在 戰事上進行順利，但是從廈門來的補給是極不理想，使東征的官兵極度乏糧，掌管大權的鄭泰竟然不發一船至台灣，以致官兵食木子充饑。使鄭成功甚至連想到在思 明（廈門）的將領是否叛變 ，以至使鄭成功在他的書桌上寫「戶失，先定罪」，其意是戶官失職，先定其罪。而戶官即是鄭泰。這點與後來的演變是否有直接關係，不得而知。（請參閱ｐ33 鄭經亂倫）
一六六二年正月鄭成功命大家將眷屬搬來台灣居住，而起先來的人水土不服，疫厲大作，病者七、八成，而死亡者亦多。加上嚴刑峻 罰，果於誅殺，人心惶惶，諸將解體，鄭泰、洪旭、黃廷等皆不願將眷屬搬來台灣。東征時在廈門的基地名義上交由世子鄭經居守，但實際上是由鄭泰、洪旭及黃廷 三人之手，而這三人離心，增加攻台戰役無比的艱辛，對鄭成功的打擊更為沈重。
一六六二年二月一日（陰曆一六六一年十二月三日）荷人訂下降約，二月十二日荷蘭人結束統治三十八年的台灣，離台撤回至印尼的巴達維亞。
清廷的和議
鄭 芝龍降清（一六四六年）後，即刻被送到北京，封為同安侯，隸漢軍正黃旗。這樣看起來似乎相當風光。但在清的壓力下一六五四年（永曆八年、順治十一年）令鄭 芝龍之子，也就是鄭成功之弟鄭世忠、世蔭到廈門，以海澄公之印及鄭芝龍親筆信誘降鄭成功，但相對的要求鄭成功投降外，尚有先獻出魯王之附帶條件。九月七日 鄭世忠、鄭世蔭二人來求成功曲全，世忠長跪不起。鄭成功說道：「爾凡子未知世事，從古易代，待降人者多無結局，惟漢光武不數見；父即誤於前，我豈蹈其後？ 我一日未受詔，父一日在朝榮耀，我若茍且受詔削髮，則父子俱難料也！爾勿多言，我豈非人類而忘父耶！箇中事未易未易！」
鄭成功作書回其父：
「違 侍膝下，八年於茲矣。但吾父既不以兒為子，兒亦不敢以子自居，坐是問候闊絕，即一字亦不相通。總繇時勢殊異，以致骨肉懸隔。蓋自古大義滅親，從治命不從亂 命。兒初識字輒佩春秋之義。自丙戍冬父駕入京時，兒既籌之熟而行之決矣。忽承嚴諭，欲兒移忠作孝。仍傳清朝面諭：有原係伯侯即與加銜等語。夫既失信於吾 父，兒亦安敢以父言為是耶？
當貝勒入關之時，父早已退避在家，彼乃卑詞巧語，迎請之使，車馬不啻十往還，甚至留父以三省之爵。始謂一到省 便可返家，既又謂一入京便可出鎮。今已數年矣，王爵且勿論，出鎮且勿論，即欲一過故里亦不可得。彼言豈可信乎？父在本朝，豈非堂堂一平國公哉！即歸清朝， 豈在人後哉？夫歸之最早者且然，而況於最後者？
又可笑者，兒先遣王裕入京，不過因有訛傳父信，聊差員探息，輒繫之於獄，備極箠楚。夫一王 裕亦做得甚事。而吠聲射影若是。其他可知，雖然兒於己丑歲燎已揚帆入粵，屯田數載矣。不意乘兒遠出，妄啟干戈，襲我中左，蹂我疆土。虔劉我士兵，擄辱我婦 女，掠我黃金九十餘萬。珠寶數百鎰 。米粟數十萬斛。其餘將士之財帛，百姓之錢穀，何可勝計？彼聞將回，乞憐於四叔，幸四叔姑存餘地，得以骸歸。乃歸而又相啟釁。我將士痛念國恥家亡。咸怒髮 指冠。是以有漳泉之師。陳錦之授首。楊名皋等之屢敗，固自出爾反爾之嘗。且不特此也。異國之兵如日本，東埔寨等諸夷兵，旦晚畢至，至欲行春秋大義矣。
(待續)
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滿人入關
生 活在長城以北，也就是俗稱關外的滿州人，在一五九九年（明神宗 萬曆二十七年），有感文字的重要，因而仿蒙古文而創作滿文。 從此滿人日益強大。有了文字僅僅四十五年即在一六四四年以不足三十萬的軍隊，入主中國。他們也根本也沒有想到，竟然如此輕易即可佔領、統治漢民族達二百六 十八年之久。
滿人在語言、文字、衣著、生活習慣上，與漢民族有絕對的不同。滿人男子之頭髮在前額部份將髮剃光，只剩下後腦蓄髮，長到六十公分左右，就把它結成辮。其他在服裝上、文化、生活水準也有極大的差距。
長城是中國與胡人千年來的國界。自秦始皇（二五九BC至二一○BC）時就動用極龐大的國家資源建立萬里長城，它是區別華夷、文明與野蠻的歷史產物。明末長城山海關守將吳三桂無敵我意識，在個人利益為優先的考量下，無視漢民族將受到的摧殘而邀請滿人入關。
滿 清之兵入關後，原本並無問鼎中原之野心，亦無足夠肆虐之武力，但能長驅直入，是採取以漢治漢 政策，每以封爵地盤，籠絡明朝降將，以此所向無敵。明末雖有忠義之士如史可法、黃道周等皆無法嚇阻清兵的攻勢，更談不上予以嚴重的打擊。其他的人不是望風 逃竄，就是靦腆投敵。若有心懷對抗異族之心的忠義之士，而沒有抗敵的武力，僅慷慨就義，多數是「平時拱手談心性，臨危一死報君恩」的儒生，與大局無補，中 原一片土崩瓦解，漢人無法對抗。如此漢民族再度遭受異族的統治，但就在閩粵之地，就讓滿人花了近四十年方征服最後一塊有漢民族意識的鄭氏王朝。
一 六四四年（明崇禎十七年、清順治元年）三月十九日崇禎皇帝自縊北京煤山 ，中國一片混亂。南方各地尋找有俱皇帝血統而成立的南明政權計有弘光（福王）、隆武（唐王）、魯王（監國）、永曆（桂王朱由榔）等，所稱的南明四王。 南明國家恢復的重任，前後寄望於流寇餘孽如高傑、李成棟、孫可望及海盜出身的鄭芝龍（又名鄭一官）等。
一六四四年五月福王由崧即位南京，明年改元弘光。次年四月揚州破史可法戰死，福王遇害。
一六四五年（弘光元年、隆武元年、順治二年）五月張國維等迎魯王於紹興，即監國位。
閏六月唐王聿鍵 由鄭芝龍、鄭鴻逵及鄭彩的閩南軍在福州（天興府）擁立唐王即位，是為隆武帝，改元隆武。芝龍封為「平國公」身兼戶、兵、工三部尚書。
魯 監國派遣都督陳謙為使來到福州會見唐王隆武帝。 陳謙與鄭芝龍是舊識，在弘光時（一六四四年），南京的福王弘光差陳謙為使，持印敕到閩府封芝龍為「南安 伯」，但是印章確誤刻為「安南伯」。南安是指小地名，而安南確是俱有大格局之意，所以陳謙教鄭芝龍，留下印章更換敕文，此事讓鄭芝龍十分感謝。 陳謙回到 浙江時，弘光帝業已蒙塵。陳謙雖沒有將安南伯的敕文更正，但是陳謙與鄭芝龍確建立起深厚的友誼。
這次陳謙奉魯王之命來到閩（福建）福 州，先與舊友兼唐王的支持者鄭芝龍招呼敘舊。 但是陳謙見到隆武帝時口稱為皇叔父，而沒有稱「陛下」，引起隆武帝大怒，並下獄。鄭芝龍得知後極力援救。隆武短視，瞞騙鄭芝龍，將陳謙在半夜移他所斬之。 鄭芝龍搶救不及，伏屍大哭。如此也造成鄭芝龍的離心。
這樣在福建的隆武與在浙江臺州的魯王（魯監國）不合，相互爭名。並互殺使者，標榜抗清的南明二王，在閩浙之間如同水火不容，忘卻了反清復明的大事。如此清軍輕易渡過錢塘江。
鄭成功
一六二四年（明 天啟四年）八月二十七日（陰曆七月十四日）生于日本九州平戶，是鄭芝龍之長子，福建省泉州安南縣四十三都 石井安平鎮 。母為日本田川氏 ，名福松，回國後名森，號大木。
鄭成功的父親鄭芝龍是縱橫東亞、南亞海上的霸主。漢民族千年來是以陸權立國，對海上不屑一顧。明末的海盜、倭寇為患，不思根本鏟除，而以「片板不得入海」這種消極的方法處理。鄭芝龍從海盜晉升為大明的官軍，再而擁立唐王聿鍵為隆武帝，如此業已掌控國家命脈。
鄭 成功在日本出生，七歲（一六三一年）時回到泉州，當時日本在幕府時代，女人是不准出境，所以只有鄭成功回來。十五歲入南安縣為「秀才」，再經考試，為南安 二十個「廩膳生」 之一，後拜浙江虞山大儒錢謙益 為師。所以鄭成功不但能詩、能文，也擅長書法。同時他又耳濡目染父親的各種軍事活動，周邊也圍繞著歷經海上風霜的鄭芝龍親信。十八歲時與董夫人結婚，而董 夫人係明禮部侍郎董颺光之胞侄女。次年生長子鄭經（乳名錦），及長到南京入太學，後由芝龍安排見隆武帝，芝龍原意是就近偵伺隆武帝，但隆武帝見成功貌偉， 撫其背曰：「惜無一女配卿，卿當盡忠吾家，無相忘也。」 一六四五年隆武帝詔賜鄭成功賜姓朱，名成功，封忠孝伯，賜尚方寶劍便宜行事，掛詔討大將軍印。從 此大家尊稱為「國姓爺」（Koxinga）。 隆武帝也賜姓給鄭鴻逵之子鄭肇基，人稱鄭肇基為小國姓。
鄭芝龍降清
鄭 芝龍本質上是國家民族觀念淡薄，是以追求自身的安全與財富為重，所以清軍南下時，意存觀望。一六四六年鄭芝龍借故海寇入犯，須往駐防，將仙霞關守將施天福 全數撤防，以利清兵之到來。清軍出韶州抵仙霞關，仙霞關二百里，無一守兵，於是清兵八月入福建，佔浦城、霞浦。福州陷入無險可守之境，隆武帝奔汀州，被清 兵所捉，絕食而亡。此時鄭芝龍兵屯家鄉安平 ，舟艦尚有五、六百艘。
清貝勒 博洛主持對閩浙戰役，因而求教於招撫江南經略洪承疇 ，他是降清明臣亦是鄭芝龍的小同鄉。 洪承疇認為明隆武帝之所有兵馬錢糧都由鄭芝龍所提供。所以鄭芝龍是關鍵人物，只要給予王爵之銜，他若靠來則福建可以不勞而獲，浙江也順勢可得。
於 是博洛派人到安平向鄭芝龍招降。芝龍接到洪承疇之書信，承諾給予三省王爵。 鄭芝龍就意向投清，但仍說「恐以立君為罪！」博洛立即退軍三十里再寫信說道： 「吾所以重將軍者，以將軍能立唐藩也；若將軍不輔立，兵未至而先附，何所取重哉！兩粵未平，將藉將軍聽威懾之，今鑄『閩粵總督印』以相待。欲將軍來見者， 商地方人才也。」 這是一項以虛有的閩粵總督之官爵來引誘的技倆，而鄭芝龍又對隆武帝的失望，鄭芝龍準備向清博洛貝勒投降，此時鄭鴻逵、鄭成功及其他將領 都加勸阻。部將周崔芝說很可惜，這樣芝龍二十年的威望，一下子就墮落下來。 鄭成功向父阻止說：「閩粵之地，非北方，得以任意馳驅。若憑高恃險，設伏以 禦，雖有百萬，恐一旦亦難飛過。然後收拾人心，以固其本。大開海道，興販各港，以足其餉；然後選將練兵，以實其力；號召天下，進取不難矣。」 鄭芝龍卻 說：「識時務為俊傑，今招我重我，就之必禮我，苟與爭鋒，一旦失利，搖尾乞憐，那時追悔莫及。豎子渺視，慎勿多談。」 成功見父不從，牽其衣，跪哭曰： 「夫虎不可離山，離山不武；魚不可離淵，離淵則困。吾父當三思而行。」芝龍反而向鄭成功說：「稚子妄談，不知天時地勢。」
成功出見到芝 龍之弟鄭鴻逵，將投清之事告向叔父。於是鄭鴻逵向鄭芝龍說：「夫人生天地間如朝露耳，能建功立業，垂名異世，則亦時不可失也。吾兄當國難之際，位極人臣， 苟時事不可為，則弟亦不敢虛鼓唇舌。況且尚帶甲數十萬，舳艫塞海，糧餉充足，輔其君以號召天下，豪傑自當響應，何委身於人？此弟所不取也！」 芝龍曰： 「吾弟所言，眼前之事，非長遠計耳。甲申 之變天下鼎沸，亦失其鹿，故清朝得而逐之，業已三皆有二。若以小丈夫之氣，振一旅而敵天下兵，恐亦不量力也。不如乘其招我，全軍歸誠，擇主而事。」 鄭芝 龍並沒有接受弟、子、部屬這些有理的勸阻。 鄭成功見父無可理喻，帶了一批人遁往金門。
鄭芝龍挑選五百名壯卒，盔甲鮮明，往福州面博洛， 同時又差人到金門，尋成功同行。成功不從回信道：「從來父教子以忠，未聞教子以貳，今父不聽兒言，倘有不測，兒只有縞素而已。」 鄭芝龍率五百人及五子鄭 世渡，自安平住所到福州天興府，向清貝勒博洛投降，路過泉州時取出博洛之信誇示眩耀，並向有興趣求官的人談價錢。 博洛得知鄭芝龍啟程來降，即令沿途各府 縣接應，凡所過驛站，供奉威儀甚嫄，又令文武官員郊外相迎。
到了福州與博洛折箭為誓，並薙髮。貝勒命酒痛飲三日，分散其五百兵，半夜忽拔營，挾持芝龍，送到北京。 鄭芝龍就這樣不明不白陷入絕境。
德國Albrecht Wirth稱鄭芝龍的降清是「滿人為捉麻雀而配的圈套竟也能適用於老鷹。」也符合西方人的一句諺語「短視到看不到自已的鼻子。」
如 果從鄭芝龍的立場來看投清之事，他原本是海盜在一六二八年應明朝之招撫，成為明朝之海將，以掃蕩海上「私通販夷」為名，將海盜同業一一制服，建立海上霸 業。進一步掌控南明國家命脈。 如今滿清南下，不久將一統中國，所以他回想以海盜成為海將的經驗，若早日投入滿清旗下，未來將有可能從海而陸，一步登天。可惜人算不若天算，豈能盡如芝龍 之意。
鄭芝龍降清之後，其原有的部隊軍事力量，也隨之分化瓦解，各自為謀，部份將領降清事敵，並沒有留什麼給鄭成功。為數眾多的鄭芝龍部屬，大都徘徊於順逆之間不知所從。
成功起兵抗清
鄭 芝龍一投降，福建沿海、廣東大部份則跟著陷入清軍掌握，清軍博洛令韓代將所部的滿漢騎步兵馬竄入鄭芝龍的家鄉安平。本以為鄭芝龍降清之後，其家鄉可視為滿 清的一部份，所以也沒防備，但是清軍開入安平，有如進入敵境，大肆掠奪並強姦鄭成功之母翁氏 ，隨後其母自縊身亡（一六四六年十一月三十日）。 成功得知消息痛不欲生，詣孔廟，焚儒服，拜而誓曰：「昔為孺子，今為孤臣，向背去留各有所用，謹謝儒服，祈先師昭鑒」遂折師海上，謀匡復大明江山，時年二 十三歲。
鄭成功之前未曾一日有兵權，意氣容貌，是儒生，在這種環境下，鄭成功不懼，一六四六年（明隆武二年、清順治三年）鄭成功決意起兵 與其弟鄭世襲（請參閱p33）徒手出門，從者十八人，在福建南安縣安平鎮（今晉江安海，與金門島相望），以「忠孝伯，招討大將軍罪臣國姓」的名義並自籌糧 餉來號召，棹小舟至鼓浪嶼，招集陳輝、洪政、楊才、張進等九十餘人。正愁沒有資金時，有自家船自日本來，成功強命徵取其資金十萬，再分乘二船，到南澳又得 到數千人的加入，佔據鼓浪嶼，攻同安及泉州。
鄭成功派遣林高攜書到日本乞師三千，並欲以平價購買堅甲貳百件。 過去唐王曾命鄭芝龍派使往 日本乞援「…請兵三千，一以聯唇齒之誼，一以報君父之仇，伏仰德威，發兵相助外，緣虜之長技，以箭為先，芝軍因乏堅甲，戰輒受傷因思日國之甲，天下共羡， 以禦弓矢，如金如石，伏懇俞允，准芝平價貿易貳百領。一同大國精兵，前來征戰…」，這個乞師之舉德川秀忠幕府曾加開會議商討其事，後因接長崎飛報，福州陷 清而作罷。其他向日乞師尚有明監國魯王，在一六四八年派馮京第、朱之瑜（朱舜水）等人使日。
鄭成功的初期閩浙沿海各據點，各有其主。而當 時鄭家部隊，除了成功新成立的部隊外，其他仍是沿襲海盜英雄本色型，沒有道義紀律，如成功之堂兄鄭彩魯王封為建國公及定遠侯鄭聯據廈門 ，成功之叔父鄭鴻逵據金門 ，上海壇、南日 、南北二茭、舟山則屬魯王部將周瑞、張振名所守，銅山、南澳為朱壽、陳豹 控制。所以鄭成功的部隊是飄泊於鼓浪嶼、海澄等地。但有堅強的將材如洪政、陳輝為左右先鋒鎮；楊才、丁鎮為親丁鎮；郭泰、余寬為左石護衛鎮；林習山為樓船 鎮；柯宸樞、楊朝為參軍；杜煇為總協理。
一六四七年四月成功復合鄭彩、楊耿等入海澄，破九都，攻漳平、龍巖。七月成功與叔父鄭鴻逵合攻泉 州，敗清提督趙國祚於桃花山。海澄人甘煇，身材五短，猛勇絕群、漳浦人藍登，武藝精熟、南安人施郎 ，機略暢曉並與其弟施顯貴等人投入鄭成功帳下。 一六四八年（永曆二年、順治五年）三月成功統林習山、甘煇攻同安，清守將祁光秋與知縣張效齡棄城，復攻泉 州。 一六四九年鄭成功攻漳浦，下雲霄，抵詔安，移屯分水關。並北聯張名振，南下潮州，向廣東發展。十一月鄭成功入南陽，進勦許隆，克達濠、青林、霞美、 新墟等寨。這兩年南征北討始終在沿海一帶飄盪，而無較好的根據地。
一六五○年（永曆四年、順治七年）鄭成功進師潮陽，知縣常翼風降。回師 時以鄭彩軍出浙江，而金、廈兩島防禦空虛，僅由嗜酒無謀的鄭聯所守而他們仍以海盜方式據地而守，肆虐不堪，民不堪命。 鄭成功依施郎之計，僅以四艦入鼓浪 嶼 ，鄭聯見成功之兵少不疑，是日乃中秋，宴於萬石巖徹夜飲樂，次日成功收編了鄭聯之軍，金、廈回復鄭氏所有，從此鄭成功才算有了固定的根據地。又遣洪政招安 銅山、南澳、閩安諸島，鄭彩之部將楊朝棟、王勝、楊權、蔡新等率全隊水師來降於成功之軍門，此時鄭彩得知鄭聯被殺，但他說：「吾老氣衰，細觀諸子弟，能繼 志者，大木耳（成功字）吾願全師解付」。所以鄭彩將兵船悉數付與鄭成功，因此部隊人數達四萬人，戰艦百艘，也有了根據地金門、廈門兩島。
一六四七年十二月十八日廣西巡撫瞿式耟在廣東肇慶 擁立桂王，並改元為「永曆」。次年鄭成功聞知，乃加額曰：「吾有君矣！」自此奉永曆為正朔。
治軍
鄭 成功他身經百場的戰役，對怯戰者、戰敗者常下令處斬極多。對貪瀆者、叛逆者也殺無赦，並常涉及全家。另一方面對有功者也大大的獎勵並提昇，對有抗爭的城 寨，常施行屠殺。 從一六四九年（永曆三年）九月起至一六六一年（永曆十五年）元月止，鄭成功所誅殺的將吏計有七十五員，這些受誅殺的將吏大都是在作戰時怯戰、戰敗者，黜降 或其他罰責有九員，無分男女老幼全予屠殺的城寨計有八處。另外有六件殺貪誅叛。 如此嚴刑峻罰配合獎勵，同期間對將吏的提昇、獎賞、爵賞，提授計有三百餘員次，而受黜革、降罰、綑責者計僅有三十餘員。 每次獎勵的原因都是戰功，常有人一月數昇，又提昇不拘原有的地位，有一卒因戰功而大大提昇為都督之事實。如此使將士用命，因而有三十員鎮將以上的將領死於 戰場上。同時也使僅佔有金門、廈門彈丸之地而能與滿清週旋十餘年之久。
鄭成功對軍士是以「膽勇為上，束兵次之」的理念來執行，所以將勇兵銳。常有在戰場上以繩索劃地為戰界，退越繩索者誅殺之，畏縮不前、無令後退者亦誅殺之。另一方面對衝鋒陷陣、斬將攀旗之功勞者于以獎勵。鄭成功本人也是勇猛異常，他計有七次在戰場上險遭顯測的記錄。
因 此鄭家軍是「怯者不敢獨退，勇者不敢獨進，膽勇成列，心力俱齊」如此軍威是造成戰場致勝的重大因素。與滿清對峙在金門、廈門時計有四十一次重要的進功戰， 全都由鄭成功親自指揮，計有三十四次勝利、七次失利。其中水戰勝利全屬鄭軍。而清軍占重要的反擊戰十四次。 但卻有十四次派遣兵將遠戍則皆失利。
鄭 氏的軍政分為兩類，一是野戰部隊，即提督、軍、衛、鎮等。另一是鎮守地方官所轄的保安部隊，如忠勇候左鎮等。提督的直屬部隊在原則上有左、右、前、後、中 五鎮。鎮以下為營、翼、司、班、兵。提督為一軍統帥，協理到副統帥。 部隊裝備有盔甲、籐牌、滾被、銃砲、刀斧等。又親軍衛鎮則有收編黑奴為兵的洋槍部 隊，即護衛一鎮，鄭經時期這黑人護衛鎮作為宮中衛隊及僕役用。
海上舟船方方面，明鄭的水師大部使用福船，亦稱大船。這種船「為樓三層，乘風沖擊，不可遏抑，其高若墉 不可抑攻；其堅若鐵石，矢石不能貫，炬不可爇。」其他尚有哨船、鳥船、蒼船、大砲船。
鄭 成功並有自創的五梅花 （請參閱ｐ74）操法，這種操法既通用於陸地，也適用於海上，更適合明鄭所處的地理環境。又鄭成功特重操練，舳艫陳列，進退有法，將士在驚濤駭浪中無異平 地，跳躑上下，矯捷如飛，將帥謁見，甲胄僅蔽身首，多赤腳，有以靴履見者，必遭罵斥，併仰其賞。因海岸多淤泥陷沙，赤腳得免粘腳，往來便捷。
明 鄭在作戰時常用地雷為攻守武器。在北伐以前，鄭清雙方在金、廈外圍計有五十八次的重要攻守戰役，鄭軍占主動的重要進攻戰有四十一次，因所處海陬一隅，不進 一步，即不能退一步的環境。所以以攻為守，以戰養戰。在歷次戰役中有許多厭惡滿清而投靠歸附的兵將，又明鄭的武力是利進，利淺略，不利深進，利乘虛，不利 攻堅，利近守，不利遠守，利於守海，不利守陸，利於野戰，不利於堅壁戰。鄭成功一生好用重兵，甚之時常傾島出師，孤注一擲。
在鄭成功一生中幾乎無月不攻，無日不戰，以進攻代替防禦，有如諸葛亮之六出祈山，以進為守。
周全斌
周全斌是福建同安浯州人，文武雙全，在一六五二年（永曆六年、順治九年）以三策獻給鄭成功，受到賞識提昇為房宿鎮參軍，一六五九年（永曆十三年、順治十六年）六月攻瓜州，周全斌奮勇率兵浮水先登，直衝敵陣，身中五箭，而氣勢越盛，諸軍繼之，於是攻下瓜州。
一 六六○年（永曆十四年、順治十七年）五月清軍出動大軍，李率泰領軍下計有索洪、賴塔、及降將施琅、黃梧等大軍來犯金、廈，風起潮湧，煙燄漫天，周全斌以竹 罌洋砲橫擊之，將黃梧軍全部打垮後，索洪、賴塔見到心寒，棄軍而個自逃命，清軍被焚溺斃數後萬計。以上可知鄭成功所調教出來的兵將，個個以一擋百，英勇異 常，以致閩軍聲名大噪。滿人調來最強的部隊也奈何不了，讓滿人百思不得其解的是同樣是漢人，為何到了福建就完全不同。
廈門失陷
一六五○年（永曆四年）十二月清軍以平南王、靖南王聯合數萬之寇廣州，因而威脅到永曆帝的根據地廣西，永曆帝傳諭旨令希望成功出兵救援。於是次年一六五一年（永曆五年、順治八年）鄭成功奉詔勤王，三月從虎門出兵廣東勤王，這是第一次南下勤王。
令 從叔鄭芝莞守廈門。清福建巡撫張學聖得知廈門防務空虛，命興泉道黃澍、泉州鎮總兵馬得功 來偷襲中左所（即是廈門）。馬得功先集合同安縣十八堡及劉五站全部民社，脅迫仍住安平的鄭芝豹（芝龍弟）派八艘船渡海。 廈門鄭方守將阮引、何德不敵，守 將鄭芝莞得知，席捲珍寶棄城欲遁，如此鄭芝莞怯戰而逃，以致廈門失陷，鄭家積蓄百萬黃金被搶、焚一空。
三月十四日董夫人（鄭成功妻）與世藩鄭經棄其輜重，只攜祖宗神位登船，見鄭芝莞之船吃水深，知船上載有重貨，堅持移乘芝莞之船，表現識大義有膽量。董夫人所懷的神牌即鄭成功之母翁氏（田川氏）。
原 本與永曆帝的晉王李定國 欲會師廣東，如今行抵揭揚，聞廣州已失，又廈門受攻擊。此時鄭成功說：「奉旨勤王，今廈門既破，顧之何益？且咫尺天顏，豈可半途而廢？國雖未報，遑顧家 為？」 這種言論使得軍士哭聲遍聞，於是諸將皆來勸駕回棹，謂「三軍各懷家屬，脫巾亦是可虞」。 如此鄭成功，向南拜曰：「臣冒涉波濤，冀近天顏，以佐恢復，不意 中左失守，將士思歸，脫巾難禁，非臣不忠，勢使然也」，於是回師廈門。
鄭成功兵至廣東揭揚時，以廈門防衛單薄，恐芝莞有失，所以命令鄭鴻 逵回兵助守。 馬得功在大淫掠後，正要離開時巧為鄭鴻達船隊從廣東回師，截斷了馬得功的歸路，鄭成功此時從路陸亦即到廈門，馬得功兩面受敵，就向鄭鴻達威 脅說：「令兄在京、母在安平」。因黃太夫人仍住安平老家，就是在滿清控制之下，鄭鴻逵在親情與國法兩難之中，放了馬得功。此事引起鄭成功對叔父鴻逵的行為 極為憤怒，終生不和鴻逵見面，這也是鄭芝龍投清的後遺症。 鄭鴻逵在兄與侄、民族與家族之間，似乎沒有空間給他，不得已就將所率軍士全給成功，退隱白沙。
鄭成功對這次廈門失陷及復得做出獎懲，取出隆武帝所賜之劍，對失職的叔父鄭芝莞斬於軍門並將芝莞船所藏金銀，搬充軍餉。對有功的施郎賞二百兩銀、加二級，轄將陳勳、鄭文星等賞一百兩等， 于是全軍皆踴躍歡呼。
這就是鄭芝龍投清造成思想分歧，敵我意識迷惑不清，所以行動受制。
另一叔父鄭芝豹卻攜鄭芝龍之妻顏氏到北京降清。
一 六五五年（永曆九年、順治十二年）春，清廷任濟度為大將軍，統兵八萬及漢兵三萬入閩。 六月，鄭軍退出漳州及屬縣，據銅山、海澄、廈門、古雷、游澳，繼續 與清兵對抗。是年鄭成功將廈門之名由中左所改為思明州，以鄧會為知州事，立儲賢館、儲材館、察言司、賓客司，設印局、軍器諸局，令六官分理國事。
廈 門是鄭成功的大本營，因此對環於廈門的地區，北起泉州，南迄潮州視為大本營的前衛站，因此近廈門的同安、長泰、海澄、漳州發生戰役多起。這是一狹長地帶， 隨時可為清軍在任何一處或一處以上的地方切斷。所以大本營的廈門是容易受到攻擊的，在廈門之役後，同年（一六五○年）五月鄭成功伐南溪，十二月伐漳浦，一 六五二年（永曆六年）攻取海澄，降其守將郝文興，進取長泰，五月圍漳州至九月。一六五三年（永曆七年）清軍圍海澄，大戰，清敗退。一六五四年十月攻取漳 州，附近十邑皆下； 一六五五年正月伐仙遊。
鐵人部隊
鄭成功在一六五八年 （永曆十二年）三月在思明集諸將提及去年在護國嶺之役中，殺敗河格商，得其衣甲，全身披掛是鐵，又幼時在日本見到日本武士的重裝備，因而產生一個概念，若 我們的人穿上鐵衣，當會更勇敢。 而有部份將領反對，說那是騎兵的裝備，因鐵甲重達三十斤，如何在戰場上，進行追、退，行動因而受制。但甘煇提出解決方 案，只要平時在兩腳上綁上沙袋來操練，久了就不怕重。
因此鄭成功下令製造被掛、鐵面等裝備。又在演武亭 設一大石重三百斤，將選中者，由鄭成功親自檢閱，令他提石繞行三圈。當場合格者五千人組成「左右衛武親軍」，號稱「鐵人」。 每人月給銀三兩，有功者擢為營將。令左虎衛鎮陳魁統之。
戴 鐵面、穿鐵裙，臉上繪有彩色彪文，其後徵得萬人，刀槍不入，常居軍隊之前鋒，執斬馬大刀，敵人皆以為是神兵，此鐵人部隊專門對付滿人之騎兵，及其他艱難的 戰役。在第一次與清軍對陣時，清軍看了就怕。 在攻台之役中，荷蘭人見到了鐵人部隊，十分懼怕國姓爺，對鐵人部隊的壯盛軍容荷人對鐵人繪有圖像。他們的述說是：「…他們（指鄭成功）的兵士有三種武器； 一部份的兵有弓箭掛在背上，左手執盾，右手拿很重的劍；另一部份士兵則兩手拿著長木棍，木棍上有彎刀；所有的兵，除兩臂和腳外，全身有鐵甲保護，上面有 魚鱗似的鐵重疊…以盾牌作掩護向敵人衝鋒，穿入敵人陣中，勇猛無比，彷彿另有一個身體放在家裡似地，拚命地前進，雖然有許多人被打死，他們也簡直不管，像 瘋狗似地猛撞，也不回頭看…」 此處所說的盾即是藤牌，很重的劍就是雲南斬馬刀。
對鐵人部隊的裝備在從征實錄的記載是：「設戎旗左右鎮，以林勝為左戎旗鎮，拔左衝鎮楊琦為右戎旗鎮，調各處鄉勇訓練銃器，配執銅百子花釬銃，設斬馬刀，不空歸木棍，每名兵另帶銃彈三粒在身，遇敵擲擊。」
藤牌部隊
鄭 成功的武力有先進的船隻、大砲、武器等，其中藤牌部隊使得擁有鐵騎的滿州兵吃盡苦頭。 藤出產在福建，以藤來做盾牌則質料輕，攜帶及使用方便，成本比起皮 革低甚多。另一個優點是利於涉水，用油浸透過的藤牌，除了能能抵禦矢石、銃彈外，其浮力大，使渡水時不必耗力泅水。 藤牌兵多與緬刀 、雲南斬馬刀配合使用，所以「刀」、「牌」並稱。
在鄭成功最精銳的部隊就是由「戎旗鎮」擴編的親軍四鎮，即武衛左鎮，武衛右鎮、虎衛左 鎮，虎衛右鎮。在成立親軍各鎮的「鐵人」部隊時，其部隊的編制是「每班帶班長六員，配雲南斬馬刀各二，牌、?各二，弓、箭則全班俱執。又十班之中，弓箭居 四，刀、牌居六。」 身著三十斤重鐵甲的鐵人部隊在渡河作戰即是靠此藤牌。 作戰時用藤牌擋住了清軍的弓箭，滾地至敵陣，專砍馬。因此懂得使用藤牌者，使 之陷陣、摧堅，十可當百。
鄭成功的部屬，無論官、兵，人人都善用藤牌，通常藤牌之數量是與神機銃器相等。
藤牌戰法大約可分為六種：
一． 滾向敵陣，專砍馬腳。
二． 在砲矢攻擊下，以牌掩護登城。在海戰中跳至敵艦亦同。
三． 以二人、三人為一組，一位舉牌作掩護，其他人作戰殺敵。
四． 以眾多的藤牌結陣護身，團體直接衝入敵陣。
五． 藤牌厝 戰法，即以眾多藤牌相連成屋而進攻。又稱「圓陣戰法」常對付滿清騎、射見長的馬隊。
六． 大帽子戰法（請參閱ｐ88）
「明 季南略」書中對鄭軍在北伐時的述說是：「…前隊長鎗，次團牌，第二陣『倭銃 』…而疾走如飛，突至馬前殺人。其兵三人一伍，一兵執團牌，蔽兩人，一邱斫馬，一兵砍人，甚銳，一刀揮鐵甲軍馬為兩段。蓋鑄刀時，用鐵匠百人挨遞打成此一 刀，故銳特甚…鄭兵不動，俱銕甲胄銕面頭子，只露兩足，用長刀砍騎，銳不可當，射中其足，則拔箭更戰，清兵逐敗…」 此處所說的團牌即藤牌，並有鐵人及藤 牌的使用。 「第一隊五十人，前有五色旗一面領之。有滾被二人；滾被者，用一大棉被厚二寸，一人執之，雙手有刀。如箭至，即張被遮候； 箭過，即捲被持刀 滾進，斫人馬足，又有團牌二人。滾被、團牌此四人俱喫雙糧。」
鄭成功在看到自已所訓練培養出來的鐵人、藤牌部隊時，曾很興奮地說：「似此可以縱橫天下矣！」
閩 粵沿海諸縣，自明朝嘉靖年間（即一五二二年至一五六六年），受到海賊、倭寇的蹂躪，也就是百年來明朝政府無能來保護人民，則人民自行武裝，故民間極為尚 武，以求自衛。通常是以家族為一戰鬥團體，又因如此，家族觀念較其他各省強烈，經常可見一二在外有成就的家族成員，則全家族的青壯都前往依附。如鄭芝龍成 為海上巨寇後，舉族弟兄子姪全都來依附。又因此軍隊的主將與官兵之間也產生了如主人與家丁的關係。就是這家主人換了第二代，則家丁當然追隨少主，這種關係 延伸到了軍中。如施天福原為鄭芝龍之部將，鄭成功起兵後即毫不猶疑地靠過來追隨鄭成功。
施琅叛逃
施琅（一六二一 至一六九六），福建晉江人。原名郎，降清後改名琅，年紀與鄭成功相仿，鄭成功起兵後與弟施顯、及甘煇、金裕、林壯猷等來投效。被提拔為左先鋒鎮。他體型魁梧，有軍事才華，智勇兼備，每戰英勇，卓著戰功，但恃才而驕。多次戰役有勇有謀，但與同僚相處不睦。
在 一六四九年（永曆三年、清順治六年）十一月，潮州之役，陳斌是潮州人，十分勇武，其手掌有常人二倍大，人稱大巴掌，熟悉當地形勢，鄭成功的這次攻潮州作戰 策略就是依其意見優先。這件事使恃才而驕的施郎不滿。又成功命施郎先斷橋，但施郎卻與清軍對敵三日不下，成功說：「諒一橋難拔，尚能圖大」之譏語，感到恥 辱，而對主攻潮州的陳斌發生不睦，引起陳斌他去，將才因而流失。又為細故率數員至大將黃廷行營辱罵，並打毀家具，成功戒之。二年後鄭成功不顧局勢險惡欲南 下勤王時，施郎反對，並以托夢為辭勸阻，成功惜其才華，僅被解除左先鋒之職，將兵權交由副將蘇茂代管，遣回廈門閒居。
一六五二年（永曆六 年）有一位原本是施郎部屬的親兵曾德，他逃出施郎後，加入成為鄭成功的親隨。有一天為施郎捉住，並準備給予懲罰，此時鄭成功下急令不可殺曾德，但持才倨傲 的施郎不理會上級的命令，將曾德處斬。此事令鄭成功極為憤怒。又施郎四處發出怨言，毫無忌憚。於是在四月二十日下令逮捕施郎、其弟施顯及父施大宣，以便處 以懲罰，並全都被捕獲。將三人全交給林習山囚在艦上，林習山下令由副將吳芳看管。施郎當夜有訪客，客走後以很興奮的話語說鄭成功只要他賠鎧甲，而非取其 命，這樣的言論來騙吳芳，如此施郎單獨逃出，置其父、弟於不顧。 鄭成功得知下令殺施大宣及施顯。施郎逃至他的副將蘇茂家住二日，蘇茂以小船將施郎送到安平，投靠鄭鴻逵，隨後就向滿清投降。
在一六五七年 （永曆十一年、順治十四年）九月陳斌等死守羅星塔，此時施琅為報復以前與陳斌不睦，就請清總督李率泰派人誘使陳斌投降。陳斌投降後全師到福州，由清總督李 率泰依名冊頒賞千人，五人一組，從東轅門入，由西轅門出，一一繳械。梟首 千有餘人。斬訖，再收陳斌殺之，施琅達成公報私仇。
黃梧叛變
黃 梧福建平和人，一六五一年（永曆五年）來歸海上，六月成功撥為中權鎮副將，八月陞為英兵營，多次戰役均無顯著戰功，但又被陞為前衝鎮。在一六五六年一月清 尚可喜兵窺揭陽，左先鋒蘇茂（請參閱ｐ16）欲出兵而戰。金武鎮郭遂第對當時的地形提出疑問：「列陣過橋，勝則猶可；倘若少怯，其橋又狹，難以退，其將如 何？」 黃梧曰：「戰則必勝，何用退兵。」 這番建言使得蘇茂喪師五千餘，有促成損將折兵之罪責。 黃梧是一位在軍事上無長才，智勇不備，無戰功，卻造成 喪師之人。在戰後的賞罰中，蘇茂因揭陽喪師被殺，黃梧、杜輝以應該支援而卻退卻，杜輝綑責六十棍，黃梧記責，各戴罪圖贖，但軍職依舊，若再犯二罪俱罰。事 實上黃梧有三百多名鐵人部隊（請參閱p13）在此役中喪生，但是來點驗人員同意以他鎮的鐵人部隊來應點，鄭成功因見到其兵甲無失，而未殺黃梧。此後黃梧日 子過得心驚膽顫，生出了降清的念頭。
滿清貝子得知鄭成功的軍令如山，而黃梧揭揚喪師心生恐懼，向黃梧誘說。事有湊巧，海澄守將王秀奇到廈門開會，將海澄防守之責暫交黃梧，黃梧得此機會，向滿清閩浙總督李率泰通知欲獻海澄，滿清以馬得功來接應。同時也誘騙蘇茂之弟蘇明降清。
一六五六年（永曆十年、清順治十三年）六月二十二日，前衝鎮黃梧殺總兵華棟，率副將蘇明、鄭純，官員八十六員及士兵一千七百名，將海澄獻給滿清。
鄭成功大部積蓄都存在易守難攻的海澄，全部都送給了滿清，損失極大，計有「糧粟二十五萬石、軍器、衣甲、銃器無數」，及各將領的私蓄。海澄是金門、廈門最重要的外圍據點，失去了海澄後即失去了金廈的屏障。
失 去海澄後的鄭成功嘆曰：「吾意海澄城為關中河內，諸凡盡積之，豈料黃梧如此悖負，後將如何用人！」。海澄的失去對鄭氏抗清而言，又延緩北伐的時間，以致在 羊山遇颶風之重大損失，更失去運用西南李定國抗清的時機，使清軍無法兼顧。後鄭成功圍攻南京，滿清即是運用征西南凱還之師，來解救南京之圍。
平海五策
黃梧的叛離向滿人投降，為買歡滿人，力向清廷奏請堅壁清野提出了「平海五策」，以斷絕鄭成功從海上獲得接濟，其內容如下：
一． 鄭氏在金廈兩島彈丸之區，得以延至今日而抗拒者，實在是由於沿海人民走險，將糧餉油鐵桅船之物供應。為今之計是將沿海省份山東、浙江、福建、廣東，四省將 沿海三十華里（一華里為五百七十六公尺）的居民全部遷徙入內地，不允許人民居住在沿海地區，並設立邊界佈置防守，如此鄭成功則不攻自滅也。
二． 將所有船隻，全部燒燬，寸板不許下海，凡溪河樹立椿柵，貨物不許越界，時刻瞭望，違者死無赦，如此半年鄭氏的海師船隻，無可修葺自然朽爛。此所謂不用戰而坐看其死也。
三． 鄭成功之父鄭芝龍雖然在京受押，但鄭成功賄賂商賈，南北興販，時通消息，宜速究此輩，嚴加懲冶貨物入官，則交通可絕矣。
四． 成功之祖先墳墓在各處，叛臣賊子罪誅及九族，何況其祖乎？應加以遷毀，慕露殄滅，使其命脈斷，則種類不待誅而自滅。
五． 投誠兵官散住各府州縣，虛靡錢糧，倘有作祟又貽害地方不淺，可將投誠官移住各省分墾荒地，不但可散其黨羽以絕後患，又可建設。
這個平海五策清廷准奏並派遣兵部尚書蘇納海，到福建推動，下令上自遼東半島南至廣東，所有居民遷入離海三十華里之內陸，對使得沿海居民，數百萬戶跋涉離鄉，顛沛流離，怨聲載道，苦不堪言。
當時滿清官員湖廣道御史李之芳也發出異聲「自古養兵，以衛疆土，未聞棄疆土，以避敵者也。」並舉出不可之理由：
１． 何以垂訓後世？
２． 廈門乃彈丸之地，不思征討，遽遷以避，其如天朝體統何？
３． 沿海是我赤子，一旦遷之，室家靡定，或浮海而遁，去此歸彼，是以民予敵。
４． 欲遷沿海一帶，當日出示，諭限數日，官兵一到，遂棄田宅、撤家產、別墳墓，號泣而報，是委民於溝洫也。
５． 遷移之民貧者不過數日之糧，富者亦但數月之儲，逼處內地，無家可依，無糧可食。餓寒逼而奸生，不為海寇，即為山賊。一夫持竿，四方響應，其若之何？
６． 今五省之民沿海已居其半，當道者不思制插安民，只欲盡以遷移，能使賊自斃乎？
７． 江南魚鹽，為富強之資。魚鹽之利何啻千萬？土產之物，百倍其利。此項年例解京，從此而止。
８． 今兵不守沿海，盡遷其民，移居內地；則賊長驅內地，直抵城邑，其誰禦之。
如此鏗鏗之言不能打動清廷，但是滿人深信遷界海禁是「不用戰而坐看其死」
在一六六○年九月，閩督李率泰奏請「遷界」，將同安縣、海澄縣開始實施遷界。
三、四兩策是針對鄭成功所施行的攻心毒計，其父被磔 於燕市，祖墓全部被掘，暴露殄滅，最剌激鄭成功。第五策在明鄭滅亡後對投降官兵徹底實施。這五策成為滿清對付鄭氏王朝的指導原則。
黃梧的平海五策外，尚附有二小項是「收拿五商（請參閱ｐ51）、沒收鄭氏田產（請參閱ｐ82）」
到 了一六七四年（永曆二十八年、康熙十三年）耿精忠反清，此時在漳州的黃梧（滿清所封的海澄公）轉降耿精忠，剪辮，耿精忠封黃梧為平和公，不久背生疽病亡， 由其子黃芳度襲封位，耿精忠就徵調漳州兵並任命劉豹守漳州。次年一六七五年在鄭經反攻大陸時，黃芳度與耿精忠不合，耿氏再度入兵漳州。黃芳度轉向鄭經投 降，卻又暗地與滿清交通。鄭經自泉率師路過漳州，黃芳度不敢來謁，禮官鄭斌受命入漳慰諭或率兵從征，或束身入覲，但黃芳度不受命。叛變之形呈於表面，鄭經 圍攻漳州，十月漳州副將吳淑，開門迎鄭經。黃芳度投開元寺井而死。鄭經開黃梧棺，戮屍，再斬黃芳度首懸掛於木桿上示眾。
在施琅、黃梧降清之前，鄭成功的將領只有殉職盡節，捐軀報國，戰死不屈之將軍，而無賣主求榮，附敵投虜之降將。施琅、黃梧甘於認賊作父，毫無民族意識為後人稱之為漢奸。滿清利用此二人分別向鄭氏將領招降。
施 琅、黃梧並常藉各種理由設計分化鄭氏將領，引誘銅山守將蔡祿、郭義叛鄭，又造謠南澳陳豹有貳心，達成鄭氏內部分化。 鄭經即位時的王位爭奪是一個製造分化 的大時機，各種正間、反間、謠言、引誘來達成明鄭內部的分裂。例如鄭泰（請參閱p35）之被殺，雖無明顯直接明証是黃梧、施琅之輩所為，但造成的傷害是無 法彌補的。
漳州、海澄二役
一六五二年（永曆六年、順治九年）鄭成功正月攻海 澄，二月攻長泰。從四月鄭成功兵圍漳州城，清福建巡撫陳錦前來救援，與成功相戰不利，退至同安之鳳尾山。在鳳山尾陳錦鞭笞其奴庫成棟，是夜庫成棟攜匕首刺 殺陳錦，割其首，前來鄭營獻首。鄭成功雖然賞其功，但也感既而說：「僕戕主而赦之，是天下無刑也！」 所以賞後，將庫成棟以叛主之名殺之。 陳錦這支軍因無主，故星散回汛。滿清派出浙鎮馬逢知率兵援漳，成功將計就計，讓馬逢知輕易入漳州城。入城之後方知成功之計策是讓城內多添人馬，糧食容易消 耗，若外部救援不及，則內部必然窘促，破城之日就近了。
漳州被圍於是清巡撫宜永貴採用圍魏救趙之法，集二百餘艘船出兵攻打成功的基地廈 門，以解漳州之圍。成功令甘煇率水師禦之，二軍相遇在崇武，甘煇大勝。到了八月築堤鎮門山，以水灌漳州城。 城內人口多，但無蓄糧，況且兵多，糧食食盡，兵奪民食，人民不敢舉煙，煙一出即知此屋灶上有物，則兵即來搶，金珠寶玩，賤如瓦礫，紙皮樹葉，亦成為糧，弱 肉強食，死亡塞戶，人食人。
九月金礪 （又名金固山，是滿州八旗的都統，滿語叫《固山額真》，當時便稱固山）與新總督劉清泰再增兵來救援漳州，然後才解漳州之圍。總計半年間有十萬軍士陣亡，沉 船千艘，漳州軍民餓死達三成，死於路上也有七成，戰後挖三大穴，穴前各立一碑，即「同歸所」、「萬安所」、「萬公所」來容納遺骸，軍民總共死亡人數達七十 三萬人。
由清將金礪固山對成功發動攻擊，解除漳州之圍後，雄心大發想一氣盡吞中國南部。於一六五三年（永曆七年、順治十年）四月進兵鄭成 功所佔的海澄，進行海澄攻防戰。清水師出福、興二港夾擊鄭成功。五月一日成功自率大隊至海澄，令王秀奇、郝文興、陳堯等守鎮遠寨，甘煇、黃廷守關帝廟，為 指揮順利，在海澄天姬宮前築將台，親登觀兵督戰。五月八日金礪全力攻鄭，砲聲震天城垣隨壞隨築，鄭成功坐將台，張蓋指揮。金礪望見傘蓋，令大砲對準傘蓋所 在的將台齊轟。諸將見砲如雨下，勸成功下台避之。但成功就是不肯，甘煇見狀不顧身份，強行將成功掖下脫離將台，剛一離台，其座椅已遭砲擊碎矣。 七月海澄 城壞百餘丈，而成功指揮自若，敵攻未逞，雙方激戰，成功設下地雷陣，一聲霹靂燒死清軍無數，金礪固山敗退回漳州。 清廷以聖旨將滿清最猛戰將金礪固山招回，以免造成更大的遺憾。
十月在清的統治下漳州有樓總劉國軒私自到廈門，先見參軍馮澄世 ，馮澄世與劉國軒長談後甚為器重。劉國軒感知已故拜馮澄世為義父。經馮澄世引見鄭成功，成功對劉國軒想來投靠頗感欣慰。十一月初一鄭成功驅軍至漳州，國軒開門降鄭，於是漳州入鄭成功之手。
南下勤王
第一次南下勤王是在一六五一年正月成功應西寧王李定國之請，至南澳備師，南下勤王。忠勇侯陳豹請見，他向鄭成功說明南下勤王不應由鄭成功親自率領，而他願意率同各鎮南下，詣會王師，若有消息，再請成功親自南下不遲。然而鄭成功認為，身受皇恩，當自率軍前往。
二月率軍至白沙湖，二十五日忽狂風大作，三月至大星所，攻克。此時福建巡撫張學聖、提督馬得功等齊攻廈門。（請參閱ｐ10廈門失陷）所以回師廈門，以致此南下勤王中途而廢。
第 二次南下勤王是在一六五四年（永曆八年）成功遣池士紳攜奏章由陸路赴安隆所（請參閱南明四王位置圖p4），向永曆帝奏明擊退清軍經過，帝爵封成功為「延平 郡王」，招討大將軍，以六部郎中各一員隨師紀錄，賜尚方劍便宜行事，甘輝為崇明伯。四月李定國分兵復定羅定、新興、石城、電白、陽江等縣。遣使約鄭成功共 取廣州。使者攜帶厚禮四色，與鄭成功議子女聯婚。
鄭成功因有前車之鑑（廈門失陷），不能親自領軍勤王，而令左軍輔侯林察為水師總督，提調 軍中一切事宜。 委右軍閩安侯為水師統領，戎旗勳鎮王秀奇為陸師左統領，左先鋒鎮蘇茂為陸師右統領，率兵數萬、戰艦百艘，是年十月十九日出師，再次南下勤王。先差效用官林 雲璿送勤王奏章到廣西給永曆帝，也同時作書知會晉王李定國（請參閱ｐ11註）。並攜帶十個月份之糧食，準備長期作戰。
可惜林察之軍行至廣東虎門時，李定國之軍是以陸師為主，在鄭成功南下勤王之師到達前，便逕自出兵進功新會，以至一戰盡失，敗走南寧，退回梧州。因此林察勤王大軍無法會師。一六五五年五月大軍回到廈門。這是第二次勤王之師又是無功而返。令鄭成功十分失望。
二次北伐
鄭 成功的軍力極強，但連年征戰，土地佔領快但也常常失去。自起兵以來七年間所攻佔的據點如：漳州、海澄、仙遊、羅源、寧德等到後來均不得不放棄而退回金門、 廈門。對此鄭成功詢問潘庚鍾、陳永華二位參軍。得到結論是「以強勢而行動敏捷的水師北伐，破崇明瓜鎮而入，直取南京，南京若得，則中原豪傑，以及川、湘、 黔、閩、浙、贛等，也會響應，則江南垂手可得，中興有望！」
北伐的另一重要原因是要解除在南方永曆帝的困境，永曆帝在一六四九年（永曆三年）春時在廣東肇慶，次年十一月遷至南寧。永曆五年至十年在安隆所，一六五七年（永曆十一年）卻敗退至雲南。若北伐將減輕清軍對永曆帝的壓迫。
一 六五八年（永曆十二年、順治十五年） 五月鄭成功率十七萬大軍，水師、騎兵、步兵各五萬人，另有二萬人機動配合作戰，其中鐵人部隊萬人，以黃廷為前提督，洪旭為兵官，鄭泰為戶官，留守廈門，而 自率甘煇等北上。 又會合魯王的兵部右侍郎張煌言（即張蒼水）、張名振大舉北伐，女眷亦隨軍出征，董夫人及鄭成功的妾媵諸子等。 六月十三日大軍出動，「連檣八十里，見者增慄」陷平陽、瑞安。七月三十一日（陰曆七月初二）抵舟山，以風信不順，即駐紮。九月七日（陰曆八月初十）艦隊北 到羊山 時，颶風怒發，碎巨艦百餘，漂沒士卒八千餘人，鄭成功廢然而返，此為第一次北伐。此役鄭成功之妾有六位 及四子鄭睿、七子鄭裕、八子鄭溫均被淹死 。
第二次北伐是在一六五九年（永曆十三年、順治十六年）又率十七萬大軍北伐，五月從舟山出發，五月十三日（陰曆）抵崇明，諸將建議先取 崇明為老營，但沒採用。由崇明入長江，七月八日（陰曆六月十九日）扺吳淞口，重申約法，「以得民為本」，這次鄭成功有必勝的決心，先奪南京，以為根本，所 以各將領均攜帶家眷同行。鎮江至瓜州十里，清用巨木築長壩，截斷江流，廣三丈，覆以泥，可行馬，左右木柵有穴，穴中有砲可射，砲石盤銃，星列江心，用圍尺 大繩，牽接木壩兩端，以拒海舟。鄭軍先以四舟揚帆而上，海舟既上又下，反復數次，清兵對鄭舟猛發炮如此五日，不傷一舟。八月三日（陰曆六月十六日）鄭軍破 瓜州，清馬兵來援，鄭軍立於水田中，砍馬足，大敗清馬兵。從南京發出清軍，由洪承疇麾下羅將軍鐵騎千人赴援，其兵鐵甲如雪。羅將軍管提督等兵，共九隊，凡 一萬五千人，而馬居半，京軍憍躁，急欲與戰。鄭軍以海舟忽進忽退，清軍馬在南則鄭艦泊于北，清軍移駐北則鄭軍泊于南，清兵逐之三日夜不息，疲之。鄭軍以藤 牌兵及鐵人部隊即全步卒以應，清馬兵至，鄭軍嚴陣以待，屹立不動，俱以團牌（藤牌）自蔽，望之如堵。清軍三卻三進，鄭軍如山。突鄭軍疾走如飛，突至馬前， 殺入。三人一伍，一兵執團牌蔽二人，一兵砍馬，一兵砍人，刀極銳，一刀揮之鐵甲軍馬切為二段。又有砲居於後，突發砲，清軍被擊斃千餘人。
八月四日奪木浮營 三座，滿清又於金山、焦山兩之間以鐵鍊橫斷江，謂之「滾江龍」，周全斌、張亮、陳大勝令善泅者十餘人，將鐵鍊斬斷。 九日陷鎮江，控制了南北咽喉。滯留五日。
此時甘煇建議：「斷瓜州，則山東之師不下，據北固，則兩浙之路不通，南都可不勞而定矣。」，可惜未能採用。 八月二十六日（陰曆七月初九日）大軍抵金陵，行軍之緩因大雨阻途，由鳳儀門登岸。八月二十九日（陰曆七月十二日）成功率諸文武遙祭明太祖陵。
此 時明魯王之兵部右侍郎張煌言也由蕪湖出兵，取徽州，已得四府（太平、寧國、徽州、池州）、三州（和州、廣德、無為）、二十四縣（當塗、蕪湖、繁昌、宣城、 寧國、南寧、南陵、太平、旌德、涇縣、貴池、銅陵、東流、建德、青陽、石埭、巢縣、含山、舒城、廬江、高淳、溧水、溧陽、建平等）。 此時江寧空虛，清軍 松江提督暗地向鄭成功洽商投降條件，致使鄭成功兵圍南京，而擁兵觀望，等清軍八十三營前來投降，局勢一片大好。 當大軍到達鎮江時，江北各縣民眾即綵旗羊 酒前來勞軍，大軍抵南京時就有人來洽降；張煌言部隊到距離儀徵尚有五十華里時，民眾就列隊在城外歡迎。江西、浙江、湖北、山東、河南諸省的民眾自動投奔帳 下，願為志願軍，整個東南已大為震動，並且延及黃河下游與長江中游。
在「明季南略」有段說明戰事：「…（清）兵馳騎突前，鄭兵嚴陣當之，屹然不 動，俱以團牌自蔽，望之如堵； 大兵三卻三進，鄭陣如山。遙見背後黑煙冉冉而起，欲卻馬再衝；而鄭兵疾走如飛，突至馬前殺人，其兵三人一伍，一兵執團牌蔽 兩人，兵砍馬，一兵砍人，甚銳，一刀揮鐵甲，軍、馬為兩段。」（請參閱ｐ14藤牌部隊），時在北京的順治皇帝得知南京將陷，欲逃回滿州。
此時鄭成功作詩一首：
縞素臨江誓滅胡，雄師十萬氣吞吳。
試看天塹投鞭渡，不信中原不姓朱！
清 軍守將郎廷佐聞鄭軍將到，將城外房屋全部燒拆，城外十里之內，所有居民全部搬入城。七月八日（陰曆）鄭兵到。郎廷佐使拖延計，他向鄭成功傳話希能在三十日 後投降。鄭成功當時驕盈，他的見解是「自舟山興師以來，戰必勝，攻必克，彼焉敢緩我之兵邪！攻城為下，攻心為上，今既來降，驟攻之，何足以服其心哉。」 同時也不想犧牲軍士，為此中計，在此之前也沒有採用甘煇的建議～留兵鎮江嚴扼咽喉，使得滿清援軍順利到來。 而成功以有令「軍無令，不許輕戰」，九月八日 （陰曆七月二十二日）清軍乘鄭軍疏於戒備時，突出猛襲。次日各路潰敗，大將甘煇、萬禮、林勝、陳魁竟為清援軍梁化鳳擊敗，甘煇被執不屈而死，鄭成功悔之晚 矣。黃安斷後，保全諸軍回棹，殘軍出海，兵員損失約十分之六、七，戰將喪失十二人，張英、甘煇殉職。損失極大。收拾殘兵十得二三而已，成功欲自殺以謝死 者，周全斌等諸將泣諫而止。十月退回到福建金門、廈門，結束了第二次的北伐。建忠臣祠，以甘煇為首。
另一方面張煌言聞鄭成功兵敗南京，欲進入江西，但也為清所敗，僅以身免。
北伐之失敗，鄭成功快速退卻，是因水師不能在陸地作持久戰，辛苦得來的城鎮即棄之，引起原先支持復明者，事後清軍的清算，飽受清吏荼毒殺戮之苦。
清軍再犯廈門
北 伐失敗引起清軍再次覬覦鄭成功的根據地金、廈兩島，一六六○年六月十七日（陰曆五月初十），清安南將軍達索 率二十萬滿漢大軍，這是一場滿清志在必得的戰役，又會同總督李率泰、碣石總兵蘇利、南洋總兵許龍、饒平總兵吳六奇等數路部隊，集水師叛將黃梧從漳州，同安 總兵施琅從同安，大舉進攻廈門，謀一舉根本鏟除鄭氏。 成功曉諭廈門兵民婦女，撥水師洪善等船盡載過烈嶼、金門，而空廈門，這是一場生死存亡的戰爭。
僅留黃安部仍守新城兼防廈門全島，鄭泰從浯嶼（金門）率兵船迎擊來自廣東清軍，鄭成功自率大軍對付漳州來軍，陳鵬守高崎迎擊來自同安的敵人。
中 午鄭成功親率巨艦衝之，又有鄭泰自浯嶼合攻，清軍受擊敗退。 但鄭方的陳鵬暗中與敵對的施琅勾結，預備為清軍內應。清軍在達素、施琅統率的同安船隊，就大大方方地向陳鵬轄區下船涉水而來，惟副將陳蟒並無與清勾結，見 敵皆已棄船登岸，勢急，不俟號令，急急發令發砲迎敵，大破清軍，死者十之七八。 成功利用風勢、海潮以巨艦向敵衝擊，清兵多北方人，不習水戰，被鄭軍斬殺殆盡。 施琅與達索駕小船逃走，清將呂哈喇被殺，死千餘人，僵屍布滿海面，損兵折將，達索返福州後，懼怕上級的譴責，羞憤吞金自盡。這一役鄭方斬及俘獲極多亦有不 少滿人。
清廷對付鄭氏，欲剿不能勝，欲撫不能成，因此體驗到用兵不能解決問題，而鄭成功又視陸上徵糧為要政，於是走入讓漢民族痛苦亦常，沿海五省實行慘無人道的「遷界」，欲使鄭軍斷絕沿海人民的支持。
雖然在這場金、廈防衛戰中大獲全勝，應可再攻清軍。但本身的人力、物力在北伐中已消耗無存，不堪再戰，況且閩浙沿海連年征戰，哀鴻遍野，十室九空，不堪再戰。
打敗荷蘭人，佔領台灣
鄭 成功在逐鹿中原失敗後，深受影響，為保証能中興明室故將眼光看到台灣。一六五六年（永曆十年、順治十三年）鄭成功對在台灣的荷蘭人及在呂宋 的西班人不滿而發佈海上貿易禁令，並徹底執行。次年荷蘭駐台長官揆一（Frederick Coyett）深受禁令之苦，故派漢人通譯何斌 （右圖）來到廈門，並以年輸餉銀五千兩（三百十二．五台斤重）、箭柸十萬枝、硫磺千擔等要求開放通商。何斌乘此機會向鄭方提出取得台灣之利「田園萬頃，沃 野千里、餉稅數十萬」，並附上航海圖。
鄭成功北伐失敗後僅存金、廈二地，土地狹小，在糧食不足，又保持家屬安全上頗多困難，雖清軍達素的 攻勢失敗羞憤吞金自盡，但滿清船隻、兵員損失無幾，隨時都有可能捲土重來，鄭軍都在極度戒備緊張之中，如今得知「田園萬頃，沃野千里、餉稅數十萬」甚為心 動。所以其自救之道即轉向為攻取台灣不失為反清復明，立萬年之基必行之路。
一六六○年六月鄭成功在思明州準備攻台，下令大修船隻，聽令出征。召集幹部黃旭、馬信、黃廷、王秀奇、陳煇、楊朝棟、林習山、吳豪、馮澄世、蔡鳴雷、薛聯桂及陳永華等人開會。
徵 詢部屬的意見並說出自己的看法：「天未厭亂，閏位（清帝）猶在，使我南都之勢，頓成瓦解之形，去年雖勝達虜（達素攻廈門）一陣，偽朝未必遽肯海戰，則我之 南北征馳，眷屬未免勞頓。前年（一六五九年）何斌所進台灣一圖，田園萬頃，沃野千里，餉稅數十萬，造船制器，吾民麟集，所優為者，近為紅夷占據，城中夷 夥，不上千人，攻之可垂手得者，我欲平克台灣，以為根本之地，安頓將領家眷，然後東征西討，無內顧之憂，並可生聚教訓也。」
大體上 「北將」（清將來降）主張攻取台灣，而「南將」（漳、泉子弟）卻是反對東征，因為台灣是海外之地，不是反清復明的目的地。 究其因是鄭軍的特色是亦兵亦 商，它是繼承海上及鄭芝龍以來的傳統，縱橫海上的霸主即是商船隊之盟主，因此南將亦兵亦商頗有積蓄，也因此較有安逸之心，對離開漳、泉這穩固商業基礎是反 對的。如宣毅後鎮吳豪他曾到台灣，就說：「港淺大船難進，且水土多瘴癘。」因此這次會議是沒有結論。
同時外來的反對言論如張煌言（請參閱ｐ21）他認為怎麼可以放棄閩浙千萬生靈，而只去攻佔一個島？若取台灣島則金門無法守，失去了金門就失去了天下人心。就做了一首譏笑詩：「寄語島上避秦客，衣冠黃綺總堪疑。」
次 年一月，即六個月後鄭成功得知在台灣的荷蘭人，因懼怕國姓爺，而從巴達維亞所派來的援軍，見無戰事而撤返巴達維亞。 此時機會成熟成功再大會文武官員，雖 有宣毅鎮吳豪、前提督黃廷出言反對，但仍有建威伯馬信及陳永華的支持。鄭成功決意親征台灣，行前表文告說：「本藩矢志恢復，切念中興，恐孤島之難居，故冒 波濤，欲闢不服之區，暫寄軍旅，養晦待時，非為貪戀海外（指台灣），苟延安樂。」
一六六一年（永曆十五年、順治十八年）四月二十一日（舊 曆三月二十三日）中午，鄭成功起兵二萬五千人、船隻九百艘攻台。船到澎湖即發生糧食不足的現象，鄭成功下令就澎湖三十七島取行糧，得到回報是：「各嶼並無 田園若種禾粟，蕃薯、大麥、黍、稷、斗升湊解，合有百餘石，不足當大師一餐之用」。 以致在風雨中鄭成功下令航向台灣。他當時說：「冰堅可渡，天意有在。 天意若付我平定台灣，今晚開駕後，自然風恬浪靜。不然，官兵豈堪坐困斷島受餓耶？」
鄭成功的部隊一上岸即將荷蘭軍打得落花流水，西方人記 述鄭成功的軍隊是：「國姓爺的軍隊中有弓箭兵，以對抗荷人的槍兵，又軍隊中有鐵人軍，每一人著鐵製的鱗甲，包住全身，鐵片長度可掩住膝蓋以下，以保護到兩 腳。這是一個武裝齊備的軍隊，他們與Thomas Pedel 的戰鬥中，無視洋槍隊的威力，沒有一個人將死亡擺在心上，勇猛無比，不管周邊有許多人被打死，照常像瘋狗似的前撲。況且他們也有相當多的重砲及充足的火 藥。」這是黃種人第一次向歐洲白人爭奪殖民地成功的例子。
登陸不到一個月，實際僅二十四天即佔領全台灣，僅留下「熱蘭遮城 」（ZEELANDIA），鄭成功十分有把握，看輕荷蘭人，也不急攻，留下一小部份軍隊包圍即勇衛、侍衛兩鎮，圍困等待荷蘭人自動來降。鄭成功指示 台灣 （指熱蘭遮城）孤城無援，攻打未免殺傷，圍困使其降；隨將各鎮分派汛地屯墾，派提督馬信督轄兵札台灣街守困之。 這個作法也兼顧軍士的生命，荷蘭人遲早要 降，也不急於一時，展現出大仁之心也。
其他來台軍隊在登陸後的第十八日，鄭成功就頒布屯田令諭，全力投入開發、生產。如此為徹底解決糧食問題，又可安頓軍隊及其眷屬。
荷人在海戰、陸戰上皆輸因而投降。
在 戰事上進行順利，但是從廈門來的補給是極不理想，使東征的官兵極度乏糧，掌管大權的鄭泰竟然不發一船至台灣，以致官兵食木子充饑。使鄭成功甚至連想到在思 明（廈門）的將領是否叛變 ，以至使鄭成功在他的書桌上寫「戶失，先定罪」，其意是戶官失職，先定其罪。而戶官即是鄭泰。這點與後來的演變是否有直接關係，不得而知。（請參閱ｐ33 鄭經亂倫）
一六六二年正月鄭成功命大家將眷屬搬來台灣居住，而起先來的人水土不服，疫厲大作，病者七、八成，而死亡者亦多。加上嚴刑峻 罰，果於誅殺，人心惶惶，諸將解體，鄭泰、洪旭、黃廷等皆不願將眷屬搬來台灣。東征時在廈門的基地名義上交由世子鄭經居守，但實際上是由鄭泰、洪旭及黃廷 三人之手，而這三人離心，增加攻台戰役無比的艱辛，對鄭成功的打擊更為沈重。
一六六二年二月一日（陰曆一六六一年十二月三日）荷人訂下降約，二月十二日荷蘭人結束統治三十八年的台灣，離台撤回至印尼的巴達維亞。
清廷的和議
鄭 芝龍降清（一六四六年）後，即刻被送到北京，封為同安侯，隸漢軍正黃旗。這樣看起來似乎相當風光。但在清的壓力下一六五四年（永曆八年、順治十一年）令鄭 芝龍之子，也就是鄭成功之弟鄭世忠、世蔭到廈門，以海澄公之印及鄭芝龍親筆信誘降鄭成功，但相對的要求鄭成功投降外，尚有先獻出魯王之附帶條件。九月七日 鄭世忠、鄭世蔭二人來求成功曲全，世忠長跪不起。鄭成功說道：「爾凡子未知世事，從古易代，待降人者多無結局，惟漢光武不數見；父即誤於前，我豈蹈其後？ 我一日未受詔，父一日在朝榮耀，我若茍且受詔削髮，則父子俱難料也！爾勿多言，我豈非人類而忘父耶！箇中事未易未易！」
鄭成功作書回其父：
「違 侍膝下，八年於茲矣。但吾父既不以兒為子，兒亦不敢以子自居，坐是問候闊絕，即一字亦不相通。總繇時勢殊異，以致骨肉懸隔。蓋自古大義滅親，從治命不從亂 命。兒初識字輒佩春秋之義。自丙戍冬父駕入京時，兒既籌之熟而行之決矣。忽承嚴諭，欲兒移忠作孝。仍傳清朝面諭：有原係伯侯即與加銜等語。夫既失信於吾 父，兒亦安敢以父言為是耶？
當貝勒入關之時，父早已退避在家，彼乃卑詞巧語，迎請之使，車馬不啻十往還，甚至留父以三省之爵。始謂一到省 便可返家，既又謂一入京便可出鎮。今已數年矣，王爵且勿論，出鎮且勿論，即欲一過故里亦不可得。彼言豈可信乎？父在本朝，豈非堂堂一平國公哉！即歸清朝， 豈在人後哉？夫歸之最早者且然，而況於最後者？
又可笑者，兒先遣王裕入京，不過因有訛傳父信，聊差員探息，輒繫之於獄，備極箠楚。夫一王 裕亦做得甚事。而吠聲射影若是。其他可知，雖然兒於己丑歲燎已揚帆入粵，屯田數載矣。不意乘兒遠出，妄啟干戈，襲我中左，蹂我疆土。虔劉我士兵，擄辱我婦 女，掠我黃金九十餘萬。珠寶數百鎰 。米粟數十萬斛。其餘將士之財帛，百姓之錢穀，何可勝計？彼聞將回，乞憐於四叔，幸四叔姑存餘地，得以骸歸。乃歸而又相啟釁。我將士痛念國恥家亡。咸怒髮 指冠。是以有漳泉之師。陳錦之授首。楊名皋等之屢敗，固自出爾反爾之嘗。且不特此也。異國之兵如日本，東埔寨等諸夷兵，旦晚畢至，至欲行春秋大義矣。
(待續)
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